smooth(MEDME)
smooth()所属R语言包:MEDME
Determining weighted MeDIP data
确定加权MeDIP数据
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
MeDIP data from tiling arrays are smoothed by determining for each probe i the weighted average of the probes within a window of size wsize centered at i
我在一个窗口大小的探针加权平均WSIZE我中心确定每个探针平铺阵列MeDIP数据平滑
用法----------Usage----------
smooth(data, wsize=1000, wFunction='linear')
参数----------Arguments----------
参数:data
An object of class MEDMEset
一个类MEDMEset对象
参数:wsize
number; the size of the smoothing window, in bp
数;平滑窗口的大小,在BP
参数:wFunction
string; the type of weighting function, to choose among linear, exp, log or none
字符串;加权函数的类型,选择其中线性,EXP,LOG或无
Details
详情----------Details----------
The un-smoothed data are read from the slot logR of the data MEDMEset and the resulting smoothed data are saved on the smoothed slot.
联合国平滑数据的读取从的数据MEDMEset的插槽logR的产生平滑的数据保存平滑槽上。
值----------Value----------
An object of class MEDMEset. In particular, the smoothed data are saved on the smoothed slot.
对象类MEDMEset。特别是,平滑的数据储存上平滑槽。
举例----------Examples----------
data(testMEDMEset)
# just an example with the first 1000 probes[只是一个例子,与1000探针]
testMEDMEset = smooth(data = testMEDMEset[1:1000,])
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|