MEDIPS.plotSaturation(MEDIPS)
MEDIPS.plotSaturation()所属R语言包:MEDIPS
Function plots the results of the MEDIPS.saturationAnalysis function.
功能图的MEDIPS.saturationAnalysis功能的的结果。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The results of the saturation analysis will be visualized by the function.
饱和度分析结果,将可视化的功能。
用法----------Usage----------
MEDIPS.plotSaturation(saturationObj = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:saturationObj
The saturation results object returned by the MEDIPS.saturationAnalysis function
饱和结果对象的MEDIPS.saturationAnalysis功能返回
值----------Value----------
The coverage plot will be visualized.
将可视化的覆盖面图。
作者(S)----------Author(s)----------
Lukas Chavez
举例----------Examples----------
library(BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19)
file=system.file("extdata", "MeDIP_hESCs_chr22.txt", package="MEDIPS")
CONTROL.SET = MEDIPS.readAlignedSequences(BSgenome="BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19", file=file)
sr.control = MEDIPS.saturationAnalysis(data = CONTROL.SET, bin_size = 50, extend = 400, no_iterations = 10, no_random_iterations = 1)
MEDIPS.plotSaturation(sr.control)
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