R语言 mdqc包 allQC()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

allQC(mdqc)
allQC()所属R语言包：mdqc

                                        QC report for MLL.B
                                         质检报告为MLL.B

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A subset of arrays from a large acute lymphoblastic leukemia (ALL) study
一个数组的子集，从一个大的急性淋巴单元白血病（ALL）的研究


用法----------Usage----------


data(allQC)



格式----------Format----------

A data frame with 20 observations on the following 11 variables.
与20以下11个变量的观测数据框。




Scale Factor a numeric vector
Scale Factor一个数值向量




Percent Present a numeric vector
Percent Present一个数值向量




Average Background a numeric vector
Average Background一个数值向量




Minimum Background a numeric vector
Minimum Background一个数值向量




Maximum Background a numeric vector
Maximum Background一个数值向量




BioB a numeric vector
BioB一个数值向量




BioC a numeric vector
BioC一个数值向量




BioD a numeric vector
BioD一个数值向量




CreX a numeric vector
CreX一个数值向量




AFFX-HSAC07/X00351.3'/5' a numeric vector
AFFX-HSAC07/X00351.3'/5'一个数值向量




AFFX-HUMGAPDH/M33197.3'/5' a numeric vector
AFFX-HUMGAPDH/M33197.3'/5'一个数值向量


Details

详情----------Details----------

Contains the QC report obtained using Bioconductor's simpleaffy package for a subset of arrays from a large acute lymphoblastic leukemia (ALL) study (<CITE>Ross et al., 2004</CITE>). The QC report in allQC has been generated using the following R commands:
包含使用数组的一个子集，从大的急性淋巴单元白血病Bioconductor的simpleaffy方案获得的QC报告（ALL）的研究（<CITE>罗斯等人，2004 </引用>）。在allQC QC报告已生成使用下面的R命令：


源----------Source----------

Ross, M. E. and Zhou, X. and Song, G. and Shurtleff, S. A. and Girtman, K. and Williams, W. K. and Liu, H. and Mahfouz, R. and Raimondi, S. C. and Lenny, N. and Patel, A. and Downing, J. R. (2003) "Classification of pediatric acute lymphoblastic leukemia by gene expression profiling." Blood 102, 2951&ndash;9.
罗斯，ME和周，十和宋，G.和Shurtleff，SA和Girtman研究和威廉姆斯，周和刘H.和马赫福兹，R.和莱蒙迪，SC和莱尼，N和帕特尔，唐宁，JR（2003）分类基因表达谱小儿急性淋巴单元白血病。“血102，2951-9。

All CEL files are freely available in http://www.stjuderesearch.org/data/ALL3/rawFiles.html.
所有CEL文件在http://www.stjuderesearch.org/data/ALL3/rawFiles.html自由的。


参考文献----------References----------

K. and Cope, L. and Irizarry R. A. and Speed T. P. (2005) &lsquo;Quality assessment of Affymetrix GeneChip data.&rsquo; In Gentleman, R. and Carey, C. J. and Huber, W. and Irizarry, R. A. and Dudoit, S. Bioinformatics and Computational Biology Solutions Using R and Bioconductor. New York: Springer.
T. P. (2007) &lsquo;Quality assessment for short oligonucleotide arrays&rsquo;. Forthcoming in Technometrics (with Discussion).

举例----------Examples----------


data(allQC)

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