printMBCBOutput(MBCB)
printMBCBOutput()所属R语言包:MBCB
MBCB - Model-Based Background Correction for Illumina Beadarray
MBCB - Illumina公司Beadarray基于模型的背景校正
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function is used to neatly output the values created by the other methods in the MBCB package.<br>
此功能用于整齐地输出参考其他方法在MBCB包创建的值。
用法----------Usage----------
printMBCBOutput(sig,
average,
rmaBool,
npBool,
mleBool,
bayesBool,
gmleBool,
avgOutputFile,
detailOutputFile)
参数----------Arguments----------
参数:sig
A list corresponding to the backgrdoun-corrected signal values (as is generated by the mbcb.correct function). The list should have elements for all desired background correction methods named 'NP', 'RMA', 'Bayes', and/or 'MLE'.
列表对应的backgrdoun校正信号值(由mbcb.correct函数生成)。列表中应该有所有所需的背景校正方法命名为的NP“,”RMA“,”贝氏和/或“MLE的”元素。
参数:average
A list containing the average values (as is generated by the mbcb.correct function). The list should have elements for all desired background correction methods named 'NP', 'RMA', 'Bayes', and/or 'MLE'.
一个列表,其中包含的平均值(由mbcb.correct函数生成)。列表中应该有所有所需的背景校正方法命名为的NP“,”RMA“,”贝氏和/或“MLE的”元素。
参数:npBool
A boolean value representing the desire to compute the non-parametric background correction values.
一个布尔值,表示的愿望来计算非参数校正背景值。
参数:rmaBool
A boolean value representing the desire to compute the RMA background correction values.
一个布尔值,表示的愿望来计算的RMA校正背景值。
参数:mleBool
A boolean value representing the desire to compute the MLE background correction values.
一个布尔值,代表愿望计算MLE的背景修正值。
参数:bayesBool
A boolean value representing the desire to compute the Bayes background correction values.
一个布尔值来计算贝叶斯校正背景值代表的愿望。
参数:gmleBool
A boolean value representing the desire to compute the GMLE background correction values.
一个布尔值,代表愿望计算的GMLE的背景修正值。
参数:avgOutputFile
The base file name to which suffixes and a file extension will be appended (i.e. 'C:/output'). These files will store the average values of each background correction method selected.
基本文件名后缀和文件扩展名,将被追加(即“C :/输出”)。这些文件将存储的每一个选择的背景校正方法的平均值。
参数:detailOutputFile
The base file name to which suffixes and a file extension will be appended (i.e. 'C:/output'). These files will store the background corrected intensities
基本文件名后缀和文件扩展名,将被追加(即“C :/输出”)。这些文件将存储的背景校正强度
值----------Value----------
This function prints corresponding CSV files based on which background-correction methods were selected.
此功能基于背景校正方法,选择相应的CSV文件打印。
作者(S)----------Author(s)----------
Yang Xie <a href="mailto: Yang.Xie@UTSouthwestern.edu"> Yang.Xie@UTSouthwestern.edu</a>, Min Chen <a href="mailto: min.chen@phd.mccombs.utexas.edu"> min.chen@phd.mccombs.utexas.edu</a>, Jeff Allen <a href="mailto: Jeffrey.Allen@UTSouthwestern.edu"> Jeffrey.Allen@UTSouthwestern.edu</a>
参见----------See Also----------
mbcb.main
mbcb.main
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注:
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