createWiggle(MassArray)
createWiggle()所属R语言包:MassArray
Create wiggle track
创建摆动轨道
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to create and write a wiggle track (UCSC Genome Browser format) to flat file from methylation data contained in a MassArrayData object
函数创建和写入1摆动轨道(UCSC基因组浏览器格式)从甲基化数据平面文件所载在MassArrayData对象
用法----------Usage----------
createWiggle(x, file = "", append = FALSE, colors = NULL, na.rm = FALSE, sep = " ")
参数----------Arguments----------
参数:x
MassArrayData object containing methylation data for at least one sample.
MassArrayData对象,其中包含至少一个样本中的甲基化数据。
参数:file
location of file to write wiggle track information; if "", wiggle track prints to the standard output connection: see cat.
文件的位置写摆动跟踪信息;如果"",摆动轨迹打印到标准输出连接:cat。
参数:append
logical; if TRUE, the output is appended to an existent wiggle track file. If FALSE (default), a new file with a new header is created and any existing file of the same name is destroyed.
逻辑;如果TRUE输出追加到一个存在的摆动轨迹文件。如果FALSE(默认),一个新的头一个新文件被创建和被摧毁任何现有的同名文件。
参数:colors
vector of colors, indicates which colors to use for which wiggle track
色彩的向量,表示使用的颜色摆动轨道
参数:na.rm
logical; if TRUE (default), missing values are removed from data. If FALSE any missing values cause an error
逻辑;如果TRUE(默认),遗漏值是从数据中删除。如果FALSE任何遗漏值导致错误
参数:sep
a string used to separate columns. Using sep = "\t" (default) gives tab-delimited output.
使用单独的列字符串。使用sep = "\t"(默认)为制表符分隔的输出。
作者(S)----------Author(s)----------
Reid F. Thompson (<a href="mailto:rthompso@aecom.yu.edu">rthompso@aecom.yu.edu</a>), John M. Greally (<a href="mailto:jgreally@aecom.yu.edu">jgreally@aecom.yu.edu</a>)
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
write, cat
write,cat
举例----------Examples----------
data(MassArray.example.data)
createWiggle(MassArray.example.data)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|