R语言 marray包 mapGeneInfo()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

mapGeneInfo(marray)
mapGeneInfo()所属R语言包：marray

                                        Creating URL strings for external database links
                                         创建外部数据库链接的URL字符串

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions are used with htmlPage. The function mapGeneInfo, takes all the arguments and generate a character matrix of two columns.  The first columns representing the name of the argument and the second columns represents the value of an argument.  The function widget.mapGeneInfo allows the user to enter this information  interactively.
使用这些功能都与htmlPage。函数mapGeneInfo，所有参数，并生成一个两列的字符矩阵。代表参数的名称，第二列的第一列代表一个参数的值。功能widget.mapGeneInfo允许用户输入信息交互。


用法----------Usage----------


mapGeneInfo(widget = FALSE, Gnames, Name = "pubmed", ID =
                 "genbank", ACC = "SMDacc", ...)
widget.mapGeneInfo(Gnames)



参数----------Arguments----------

参数：widget
A logical value specifying if widgets should be used.
应使用一个逻辑值，指定如果部件。


参数：Name
The external database for spot description, E.g. "pubmed".
对现场的描述，例如外部数据库“医学”。


参数：ID
The external database for spot ID, E.g. "operon", "Riken", "locuslink".
现货ID外部数据库，例如“操纵”，“理研”，“locuslink”。


参数：ACC
The external database for gene accession number, E.g. "genebank".
基因的加入，如外部数据库“基因库”。


参数：Gnames
An object of class matrix, data.frame or marrayInfo which contains  description of spotted probe sequences.
一个类的对象matrix，data.frame或marrayInfo其中包含斑点探针序列的描述。


参数：...
Other column names
其他列名


Details

详情----------Details----------

The function mapGeneInfo generates a character matrix with the first column representing the column headings of "Gnames" and the second column representing the corresponding names in the list URLstring.  For example, if a particular column in "Gnames" with column names "ID" contains genebank accession number, then the function mapGeneInfo generates a row containing "ID" in the first column and "genbank" in the second.  Examples are SFGL and UCBFGL.<br>
功能mapGeneInfo生成字符矩阵，第一列代表“Gnames”列标题和第二列代表列表URLstring相应的名称。例如，如果在特定列的列名的“身份证”的“Gnames”包含基因库加入数量，那么该函数mapGeneInfo生成行，第一列中包含“身份证”和“序列”在第二。例子是SFGL和UCBFGL参考。

URLstring is a list contains the URL to various external database, E.g. operon, Riken, genbank. <br> The current choices are:  "pubmed",  "locuslink",  "riken",   "SMDclid",    "SMDacc",    "operonh2",  "operonh1" , "operonm2",  "operonm1" and  "genbank" .   "SMDclid" and "SMDacc" are links to Stanford Microarray Databases.
URLstring是一个列表包含各种外部数据库的URL，例如：操纵，理研，GenBank中。参考目前选择是：“医学”，“locuslink”，“理研”，“SMDclid”，“SMDacc”，“operonh2”，“operonh1”，“operonm2”，“ operonm1“和”序列“。 “SMDclid”和“SMDacc”斯坦福芯片数据库的链接。


作者（S）----------Author(s)----------


Jean Yee Hwa Yang



举例----------Examples----------


mapGeneInfo(ID="genebank", ll="locuslink")
mapGeneInfo(ID="locuslink", Sample.ID="riken")

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