R语言 makecdfenv包 make.cdf.env()函数中文帮助文档(中英文对照)

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make.cdf.env(makecdfenv)
make.cdf.env()所属R语言包：makecdfenv

                                        CDF Environment Maker
                                         民防部队环境Maker中

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reads an Affymetrix chip description file (CDF) and creates an
读取Affymetrix公司芯片的描述文件（CDF），并创建一个


用法----------Usage----------


make.cdf.env(filename,
             cdf.path = getwd(),
             compress = FALSE,
             return.env.only = TRUE,
             verbose = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：filename
Character. Filename of the CDF file - without the path prefix!
字符。 CDF文件 - 不带路径前缀的文件名！


参数：cdf.path
Character. Path to the CDF file.
字符。 CDF文件的路径。


参数：compress
Logical. If TRUE, CDF file is compressed.
逻辑。如果TRUE，CDF文件被压缩。


参数：return.env.only
Logical. If TRUE (the default), then the function returns an environment. Otherwise, a list with two elements, the first being the environment, and the second being a data structure that contains additional information needed for the package builder (see details, and vignette).
逻辑。如果TRUE（默认），那么该函数返回一个环境。否则，有两个因素，首先是环境，第二个是一个数据结构，它包含包生成器所需的额外信息（见详情，和Vignette）。


参数：verbose
Logical. If TRUE, messages are shown.
逻辑。如果TRUE，信息显示。


Details

详情----------Details----------

Normally, this function should not be called directly. The preferred way to handle CDF information is to use make.cdf.package to build a package, and to install it into R. The CDF information can then either be invoked automatically by the package affy, or can be loaded manually by calling, for example, library(hgu133a).
通常情况下，此功能不应该被直接调用。处理民防信息的首选方式是使用make.cdf.package构建一个软件包，并安装到R.民防信息，然后可以被调用的包自动affy，或可以手动加载通过调用，例如，library(hgu133a)。

Some R installations (typically on Windows) do not offer all the tools that are necessary for package building. In such situations, this function may be called directly. Please see the vignette for details - type:
一些安装（通常在Windows上）不提供包建设所必需的所有工具。在这种情况下，这个功能可以直接调用。请参阅有关详情的小插曲 - 类型：

openVignette("makecdfenv")
openVignette("makecdfenv")

Return values:   env is an environment, used as a hash table. For every probe set name we have a matrix with 2 columns. The first column contains the PM locations and the second column the MM locations. For PM only chips the MM column will have NAs.
返回值：env是一个环境，作为一个哈希表。对于每一个探针组的名称，我们有2列的矩阵。第一列包含PM地点和第二列的MM位置。为下午只芯片的MM列将有NAS。

syms is a list that contains chip-specific (i.e., CDF-file specific) information that can be used in the construction of the help files for the CDF package.
syms是一个列表，其中包含特定芯片的信息，可用于建设的CDF包帮助文件（即，民防部队文件的具体）。


值----------Value----------

Depending on the argument return.env.only, either the environment, or a list with two elements,
根据参数return.env.only，无论是环境，或有两个元素的列表，


作者（S）----------Author(s)----------


Rafael A. Irizarry, Wolfgang Huber



参见----------See Also----------

make.cdf.package
make.cdf.package


举例----------Examples----------


  env <- make.cdf.env("Hu6800.CDF.gz",
           cdf.path=system.file("extdata", package="makecdfenv"),
           compress=TRUE)
  length(ls(env))
  get("U53347_at", env)          

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注：
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