R语言 maigesPack包 plotGenePair()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotGenePair(maigesPack)
plotGenePair()所属R语言包：maigesPack

                                         Scatter plots for pair of genes
                                         对基因的散点图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function displays scatter plots for pair of genes that presented altered correlation values in Relevance Network analysis.
此功能显示双基因关联网络分析提出修改相关值的散点图。


用法----------Usage----------


plotGenePair(obj, gene1, gene2, posL=NULL, rCor=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：obj
object of class maigesRelNetM.
对象类maigesRelNetM。


参数：gene1
character string giving the first gene identification.
字符串给人的第一个基因鉴定。


参数：gene2
character string giving the first gene identification.
字符串给人的第一个基因鉴定。


参数：posL
numerical vector of length 2, specifying the x and y position of the legend.
数值向量长度为2，指定x和y位置的传说。


参数：rCor
logical specifying if the correlation are robust (calculated by the function robustCorr. Defaults to TRUE.
逻辑指定的相关性，如果是强劲（robustCorr。默认为true的功能计算。


Details

详情----------Details----------

This function only picks the result of the relNetworkM and display scatter plots for a pair of genes giving the regression lines and the correlation values for the two biological groups tested.
此功能只挑选relNetworkM“显示了一双给回归线和相关值测试的两个生物类群的基因散点图的结果。


值----------Value----------

This function don't return any object.
这个函数不返回任何对象。


作者（S）----------Author(s)----------



Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参见----------See Also----------

maigesRelNetM, robustCorr, relNetworkM.
maigesRelNetM，robustCorr，relNetworkM。


举例----------Examples----------


## Loading the dataset[＃载入数据集]
data(gastro)

## Constructing the relevance network for sample[＃样品的相关网络建设]
## 'Tissue' comparing 'Neso' and 'Aeso' for the 1st gene group[＃组织“NESO”和“Aeso”的第一个基因组比较]
gastro.net = relNetworkM(gastro.summ, sLabelID="Tissue",
  samples = list(Neso="Neso", Aeso="Aeso"), geneGrp=11,
  type="Rpearson")

## As the sample size is small, because we used a small fraction of the[＃由于样本量小，因为我们使用的一小部分]
## genes from the original dataset, this isn't so reliable.[＃从原始数据集的基因，这是不那么可靠。]
plotGenePair(gastro.net, "KLK13", "EVPL")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。