R语言 maigesPack包 normScaleMarray()函数中文帮助文档(中英文对照)

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normScaleMarray(maigesPack)
normScaleMarray()所属R语言包：maigesPack

                                         Scale adjust a cDNA Microarray Object
                                         规模调整的cDNA微阵列对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function loads a maigesRaw or maiges object and scale adjust (normalise between arrays) the data using functions from marray package.
这个函数加载maigesRaw或maiges对象和规模的调整（标准化阵列之间）的数据从marray包使用功能。


用法----------Usage----------


normScaleMarray(obj=NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：obj
object of type maigesRaw or maiges to be  normalised.
对象类型maigesRaw或maiges标准化。


参数：...
additional parameters for function maNormScale.
功能maNormScale额外的参数。


Details

详情----------Details----------

This function for scale adjustment is entirely based on function maNormScale from marray package. See the help page for this function to see how to set the parameter. Pay attention to the subset argument that is fixed directly from the UseSpots and BadSpots from obj object, and must not be specified in the additional arguments.
这种规模调整的功能，完全是基于功能maNormScale从marray包。这个功能来看看如何设置参数，请参阅帮助页面。注意subset参数是固定的，直接从UseSpots和BadSpots从obj对象，而且必须不能指定额外的参数。

The functionality of the scale adjustment function from marray package was added because it uses an estimator of MAD different from that one used in limma package. Also, using  maNormScale function it is possible to do print tip scale adjustment.
marray包规模调整功能的功能增加了，因为它使用狂limma包使用不同的估计。此外，使用maNormScale函数做打印尖规模的调整是有可能的。


值----------Value----------

This function returns a maiges object.
此函数返回一个maiges对象。


作者（S）----------Author(s)----------



Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参见----------See Also----------

maNormScale from marray package.
maNormScale从marray包。


举例----------Examples----------


## Loading the dataset[＃载入数据集]
data(gastro)

## Doing global MAD scale adjustment[＃做全球MAD大规模调整]
gastro.norm = normScaleMarray(gastro.norm, norm="globalMAD")
boxplot(gastro.norm) ## To see the effect of MAD adjustment[＃要看到狂调整的影响]

## For print tip MAD use the following command[＃打印尖狂使用以下命令]
## Not run: [＃无法运行：]
gastro.norm = normScaleMarray(gastro.norm, norm="printTipMAD")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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