normOLIN(maigesPack)
normOLIN()所属R语言包:maigesPack
Normalise a cDNA Microarray Object
Normalise cDNA微阵列对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function loads a maigesRaw object and normalise it using methods OLIN or OSLIM.
这个函数加载maigesRaw对象和使用方法奥林或OSLIM的标准化。
用法----------Usage----------
normOLIN(obj=NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数:obj
object of type maigesRaw to be normalised.
对象的类型maigesRaw被归。
参数:...
additional parameters for function olin.
功能olin额外的参数。
Details
详情----------Details----------
This function for normalisation is entirely based on function olin from OLIN package. This function implements the methods OLIN and OSLIM, proposed by Futschich and Crompton (2004). See help page for this function to discover how to set the parameters.
此功能的标准化,完全是基于功能olin从奥林包。此功能实现方法奥林和OSLIM的,由Futschich和Crompton(2004)提出。看到此功能,以发现如何设置参数的帮助页。
值----------Value----------
This function returns a maiges object.
此函数返回一个maiges对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Gustavo H. Esteves <<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>>
参考文献----------References----------
for normalization of cDNA microarray data, Genome Biology, 5, R60, 2004 (http://genomebiology.com/2004/5/8/R60).
参见----------See Also----------
olin from OLIN package.
olin从欧林包。
举例----------Examples----------
## Loading the dataset[#载入数据集]
data(gastro)
## Doing the OLIN normalization. Pay attention because, this methods are[#做好奥林标准化。注意,因为这种方法是]
## very time consuming![#非常耗时!]
## Not run: [#无法运行:]
gastro.norm = normOLIN(gastro.raw2) ## Without scale adjustment[#如果没有大规模调整]
gastro.norm = normOLIN(gastro.raw2, OSLIN=TRUE) ## With scale adj[随着规模的形容词#]
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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