R语言 maigesPack包 designANOVA()函数中文帮助文档(中英文对照)

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designANOVA(maigesPack)
designANOVA()所属R语言包：maigesPack

                                         Function to construct design an contrasts matrices for ANOVA models
                                         ANOVA模型设计一个对比矩阵函数构造

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes an object of class maiges together with other arguments and construct the matrices of design and contrasts for adjusting ANOVA models. The design matrix are generated using the function model.matrix.
此函数需要一个对象类maiges连同其他参数和调整ANOVA模型构造设计和对比矩阵。设计矩阵生成使用功能model.matrix。


用法----------Usage----------


designANOVA(data=NULL, factors=names(data@Slabels), model=NULL,
            contrasts=NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：data
object of class maiges.
对象类maiges。


参数：factors
vector of character strings specifying the sample labels IDs to be used as factors in the models.
矢量字符字符串指定的样品标签标识作为模型中的因素。


参数：model
a formula specifying the model to be fitted.
要安装指定的模型公式。


参数：contrasts
character vector specifying the contrasts to be done. This is done by the function makeContrasts from package limma. Pay attention that we use the treatment-control parametrisation.
指定字符向量进行对比。这是通过功能makeContrasts包limma。注意我们使用治疗控制parametrisation的。


参数：...
additional parameters for function model.matrix.
功能model.matrix额外的参数。


值----------Value----------

The result of this function is an object of class maigesANOVA.
这个函数的结果是一个对象类maigesANOVA。


作者（S）----------Author(s)----------



Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参见----------See Also----------

model.matrix, makeContrasts, deGenesANOVA.
model.matrix，makeContrasts，deGenesANOVA。


举例----------Examples----------


## Loading the dataset[＃载入数据集]
data(gastro)

## Constructing a maigesANOVA object for the 'Tissue' sample label using[＃1 maigesANOVA对象构建“组织”的样品使用标签]
## default model (simple linear model with intercept) and contrasts (all[＃默认模型（简单线性模型与拦截）和对比（所有]
## parameters are equal between themselves)[＃参数，它们之间是平等的）]
gastro.ANOVA = designANOVA(gastro.summ, factors="Tissue")
gastro.ANOVA

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