R语言 maigesPack包 deGenes2by2Ttest()函数中文帮助文档(中英文对照)

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deGenes2by2Ttest(maigesPack)
deGenes2by2Ttest()所属R语言包：maigesPack

                                         Function to do differential expression analysis, comparing only two samples
                                         功能做差异表达分析，比较，只有两个样品

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes an object of class maiges and do differential expression analysis for the genes onto dataset, comparing only two samples, by t test.
此功能需要一个类maiges“不差到DataSet中的基因表达分析，比较采用t检验，只有两个样品，对象。


用法----------Usage----------


deGenes2by2Ttest(data=NULL, sLabelID=names(data@Slabels)[1], sTypeComp=NULL,
                 doClust=TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：data
object of class maiges.
对象类maiges。


参数：sLabelID
character string giving the sample label ID to be used.
字符串提供样品标签标识的使用。


参数：sTypeComp
list with character vectors specifying the two sample types to be compared.
列出字符指定要比较两个样本类型的向量。


参数：doClust
logical indicating if the object generated from this analysis will be used for cluster analysis. Defaults to TRUE.
逻辑表明，如果从这个分析生成的对象将使用聚类分析。默认为true。


参数：...
additional parameters for function t.test.
功能t.test额外的参数。


Details

详情----------Details----------

This function calculate t statistics and p-values for the test of difference in the means of the groups using the function t.test.
此功能的测试手段的使用功能t.test组的差异计算t统计量和p值。

There are other two functions, deGenes2by2Wilcox and deGenes2by2BootT, to do non-parametric tests by the Wilcox test an t statistic bootstrap, respectively.
还有其他两个功能，deGenes2by2Wilcox和deGenes2by2BootT，威尔科克斯检验t统计引导非参数检验，分别。


值----------Value----------

The result of this function is an object of class maigesDE if doClust if FALSE or of class maigesDEcluster if it is TRUE.
这个函数的结果是一个类的对象maigesDE如果doClust如果为FALSE或类maigesDEcluster如果这是真的。


作者（S）----------Author(s)----------



Gustavo H. Esteves &lt;<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>&gt;




参见----------See Also----------

t.test, deGenes2by2Wilcox and deGenes2by2BootT.
t.test，deGenes2by2Wilcox和deGenes2by2BootT。


举例----------Examples----------


## Loading the dataset[＃载入数据集]
data(gastro)

## Doing t test fot 'Type' sample label[＃t检验FOT类型做样品标签]
gastro.ttest = deGenes2by2Ttest(gastro.summ, sLabelID="Type")
gastro.ttest

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