createMaigesRaw(maigesPack)
createMaigesRaw()所属R语言包:maigesPack
Function to create objects of class maigesRaw
创建类maigesRaw对象的函数
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to create objects of class maigesRaw from objects of class maigesPreRaw.
maigesRaw类maigesPreRaw的对象函数来创建类的对象。
用法----------Usage----------
createMaigesRaw(PreRaw, greenDataField, greenBackDataField, redDataField,
redBackDataField, flagDataField, gLabelGrp, gLabelPath)
参数----------Arguments----------
参数:PreRaw
object of class maigesPreRaw to be used to generate another object of class maigesRaw.
对象类maigesPreRaw被用来生成另一个对象的类maigesRaw。
参数:greenDataField
character string specifying the name of the Data slot from PreRaw that will be used to read the spot intensity values for green channel.
字符串指定Data插槽的名称从PreRaw将用于阅读绿色通道当场强度值。
参数:greenBackDataField
character string specifying the name of the Data slot from PreRaw that will be used to read the background intensity values for green channel.
字符串指定Data插槽的名称从PreRaw将用于阅读绿色通道的背景强度值。
参数:redDataField
character string specifying the name of the Data slot from PreRaw that will be used to read the spot intensity values for red channel.
字符串指定Data插槽的名称从PreRaw将用于读点强度值的红色通道。
参数:redBackDataField
character string specifying the name of the Data slot from PreRaw that will be used to read the background intensity values for red channel.
字符串指定Data插槽的名称从PreRaw将用于阅读的红色通道的背景强度值。
参数:flagDataField
character string specifying the name of the Data slot from PreRaw that will be used to read the flag values.
字符串指定Data插槽的名称从PreRaw将用于阅读的标志值。
参数:gLabelGrp
character string with the gene label to match gene groups.
字符串匹配基因组的基因标签。
参数:gLabelPath
character string with the gene label to match gene networks.
字符串与基因标签匹配的基因网络。
值----------Value----------
The result of this function is an object of class maigesRaw.
这个函数的结果是一个对象类maigesRaw。
作者(S)----------Author(s)----------
Gustavo H. Esteves <<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>>
参见----------See Also----------
loadData, maigesPreRaw,
loadData,maigesPreRaw
举例----------Examples----------
## Load a little dataset[#加载一个小的数据集。]
data(gastro)
## See the object[#见的对象。]
gastro
## Transform gastro into a maigesRaw object[#变换胃成maigesRaw对象]
gastro.raw = createMaigesRaw(gastro, greenDataField="Ch1.Mean",
greenBackDataField="Ch1.B.Mean", redDataField="Ch2.Mean",
redBackDataField="Ch2.B.Mean", flagDataField="Flags",
gLabelGrp="GeneName", gLabelPath="GeneName")
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