bootstrapCor(maigesPack)
bootstrapCor()所属R语言包：maigesPack
Calculate bootstrap p-values for correlation measures
p值的计算相关措施引导
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function takes a numerical matrix (or two vectors) and calculates bootstrapped (by permutation) p-values to test if the correlation value is equal to zero. If the first argument is a matrix, the p-values are calculated between all pairs of rows of the matrix.
这个函数接受一个数值矩阵（或两个向量），并计算自举（置换）p值来测试，如果相关值等于零。如果第一个参数是一个矩阵，对矩阵的行之间的所有P-值计算。
用法----------Usage----------
bootstrapCor(x, y=NULL, bRep, type="Rpearson", ret="p-value",
alternative="two.sided")
参数----------Arguments----------
参数：x
numerical matrix or vector to be analysed. If a vector, the argument y must be informed.
数值矩阵或向量来进行分析。如果一个向量，参数y必须通知。
参数：y
numerical vector. Must be informed if x is a vector. If x is a matrix, this argument is ignored. Defaults to NULL.
数值向量。必须被告知，如果x是一个向量。如果x是一个矩阵，这个参数将被忽略。默认为空。
参数：bRep
number of permutation to be done in the test.
数排列在完成测试。
参数：type
character string specifying the type of correlation statistic to be used. Possible values are 'Rpearson', 'pearson', 'spearman' or 'kendall'.
字符串指定要使用的相关统计数据的类型。可能的值是“Rpearson，培，矛或肯德尔。
参数：ret
character string with the value to return. Must be 'p-value' (default) for the usual p-value or 'max', to return the maximum absolute correlation value obtained by the permutation.
返回的值的字符串。必须是“p值”（默认）为一般p值或“最大”，返回的最大绝对相关置换获得的价值。
参数：alternative
character specifying the type of test to do, must be 'two.sided' (default), 'less' or 'greater'.
字符指定的测试做的类型，必须是“two.sided”（默认），“少”或“大”。
Details
详情----------Details----------
Pearson, spearman and kendall types of correlation values are calculated by cor function from package stats. The method Rpearson was developed in this package and is a generalisation of the jackniffe correlation proposed by Heyer et al. (1999), it is calculated using the function robustCorr.
皮尔森相关值，Spearman和Kendall类型计算cor包统计功能。在此包的方法Rpearson开发和海耶等人提出的jackniffe相关的推广。 （1999年），它的计算使用的功能robustCorr。
值----------Value----------
The result of this function is a square matrix (length equal to the number of rows of x) if x is a matrix or a numerical value if x and y are vectors. The result is the p-values or maximum correlation values calculated by permutation tests.
这个函数的结果是x是一个矩阵或一个数值x和x是一个方阵（长度等于y行数）向量。结果是P-值或通过排列测验的最大相关值计算。
作者（S）----------Author(s)----------
Gustavo H. Esteves <<a href="mailto:gesteves@vision.ime.usp.br">gesteves@vision.ime.usp.br</a>>
参考文献----------References----------
identification and analysis of coexpressed genes, Genome Research, 9, 1106-1115, 1999 (http://www.genome.org/cgi/content/full/9/11/1106)
参见----------See Also----------
cor, robustCorr
cor，robustCorr
举例----------Examples----------
x <- runif(50, 0, 1)
y <- rbeta(50, 1, 2)
bootstrapCor(x, y, bRep=100)
z <- matrix(rnorm(100, 0, 1), 4, 25)
bootstrapCor(z, bRep=100)
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发表于 2012-2-26 00:03:50
