riplot(maanova)
riplot()所属R语言包：maanova
Ratio intensity plot for 2-dye Microarray experiment
2染料微阵列实验的比强度图
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function only works for 2-dye array at this time. It will plot the log-ratio (log2(R/G)) versus log-intensity (log2(R*G)/2) figure for Micro Array experiment. Ideal RI plot will be points scattered around the y=0 horizontal line.
此功能只适用于在这个时间为2染料阵列。这将绘制数比（为log2（的R / G））与log强度（为log2（ŕ*Ğ）/ 2）微阵列实验的数字。理想RI图将围绕在y = 0的水平线散点。
This function works for madata. This function and arrayview assume the data is on log2 based scale. So if your rawdata is not pre-transformed, you should not do riplot on the raw data.
此功能为madata。此功能和arrayview假设数据是log2基于规模。因此，如果您的rawData不预先转化，你不应该对原始数据做riplot。
用法----------Usage----------
riplot(object, title, xlab, ylab, array, color = "blue",highlight.flag = TRUE,
flag.color = "Red", idx.highlight, highlight.color = "Green",
rep.connect = FALSE, onScreen=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数：object
An object of class madata.
对象类madata。
参数：title
The title for figures. The default figure title is "RI plot for array number X". If the user wants to provide titles, be sure to provide a string array with the same number of elements as the number of arrays.
对数字的称号。默认图的标题是“RI阵列数字X图”。如果用户要提供职称，确保提供相同数量的阵列元素的字符串数组。
参数：xlab
The xlab for figures. The default figure xlab is "expression(log[2](R*G))". One xlab would be used for all plot, thus unlike title, user (if one wants) need to provide only one name.
的数字XLab中。 XLab中的默认数字是“表达（登录[2]（的R * G）的）”。将用于一个XLab中所有的图，因此不同的标题，用户（如果想）只需要提供一个名称。
参数：ylab
The ylab for figures. The default figure ylab is "expression(log[2](R/G))". One ylab would be used for all plot, thus unlike title, user (if one wants) need to provide only one name.
的数字ylab。默认的的数字ylab是“表达（记录[2]（的R / G））”。一个ylab将用于所有的图，因此不同的标题，用户（如果想）只需要提供一个名称。
参数：array
A list of arrays numbers for which you want to draw an RI plot.
阵列的数字为你想画一个RI图名单。
参数：color
The color for the points in scatter plot. Default is blue.
散点图中的点的颜色。默认为蓝色。
参数：highlight.flag
A logical parameter to indicate whether to highlight the bad spots or not.
逻辑参数指示是否突出的烂斑或不。
参数：flag.color
The color for bad spots, default is red.
坏点的颜色，默认是红色的。
参数：idx.highlight
A vector for highlighted spots other than bad spots.
坏点以外的一个突出景点的向量。
参数：highlight.color
The color for highlighted spots. Default is green.
突出斑点的颜色。默认是绿色的。
参数：rep.connect
A logical value to represent whether to connect the dots between the replicates or not.
一个逻辑值表示是否要连接的点之间的重复或不。
参数：onScreen
A logical value to represent whether to display the plots on screen or not. If TRUE, x11() (in Unix/Windows) or macintosh() (in Mac) will be called inside the function. Otherwise, it will plot the figure on the current device. Default is TRUE.
一个逻辑值表示是否要显示在屏幕上的图或不。如果为TRUE，X11（）（在Unix / Windows）或苹果（）（在Mac）将调用内部函数。否则，它将绘制当前设备上的数字。默认值是TRUE。
注意----------Note----------
This function will plot one figure for each array. So if you have many arrays, there will be many figures generated.
此功能将绘制一个数字为每个阵列。所以，如果你有很多的阵列，将产生许多数字。
作者（S）----------Author(s)----------
Hao Wu
举例----------Examples----------
## Not run: [＃无法运行：]
data(kidney)
# riplot raw data on screen[riplot屏幕上的原始数据]
riplot(kidney.raw)
graphics.off()
# riplot raw data array 1 and 3 and output to postscript file[riplot原始数据阵列1和3和输出到PostScript文件]
postscript(file="kidneyRIplot.ps")
riplot(kidney.raw, array=c(1,3), onScreen=FALSE)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-25 23:56:30
