plotStringencyGene(lumi)
plotStringencyGene()所属R语言包:lumi
plot the Stringency related control probe profiles
绘制相关的严格控制探针概况
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plot the Stringency related control probe (Low-Stringency, Medium-Stringency and High-Stringency) profiles. Using getControlType function to view available stringency types.
绘制相关的严格控制探针(低紧绌,中等紧缩和高严谨)型材。使用getControlType功能,以查看可用的严格类型。
用法----------Usage----------
plotStringencyGene(controlData, lib = NULL, slideIndex = NULL, addLegend = TRUE, logMode = TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:controlData
a LumiBatch object including control data or a control data data.frame
1 LumiBatch对象,包括控制数据或控制数据数据框
参数:lib
the annotation library (for retrieving the gene name)
注释库(基因名称检索)
参数:slideIndex
the slide index or ID corresponding to each sample
每个样本对应的幻灯片索引或ID
参数:addLegend
whether add legend or not
是否添加图例或不
参数:logMode
whether show the data in log2 scale
是否表明以log2规模的数据
参数:...
other parameters used by default matplot function
由用于默认matplot功能的其他参数
值----------Value----------
plot the picture and return TRUE if everything is OK
绘制的图片,并返回TRUE,如果一切正常
作者(S)----------Author(s)----------
Pan Du
参见----------See Also----------
addControlData2lumi, plotControlData
addControlData2lumi,plotControlData
举例----------Examples----------
controlFile <- system.file('doc', 'Control_Probe_Profile.txt', package='lumi')
controlData <- getControlData(controlFile)
plotStringencyGene(controlData)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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