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nuID2IlluminaID(lumi)
nuID2IlluminaID()所属R语言包：lumi

                                        Matching nuIDs to Illumina IDs based on Illumina ID mapping library
                                         将匹配nuIDs Illumina的ID映射库为基础的Illumina的ID

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Matching nuIDs to Illumina IDs based on Illumina ID mapping library
将匹配nuIDs Illumina的ID映射库为基础的Illumina的ID


用法----------Usage----------


nuID2IlluminaID(nuID, lib.mapping=NULL, species = c("Human", "Mouse", "Rat", "Unknown"), idType=c('All', 'Probe', 'Gene', 'Accession', 'Search_key', 'Symbol'), chipVersion = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：nuID
a vector of nuIDs  
的nuIDs向量


参数：lib.mapping
the ID mapping library. If it is provided, the parameter "species" will be ignored.  
ID映射库。如果它提供的参数将被忽略“物种”。


参数：species
the species of the chip designed for. If users do not know it, it can be set as "Unknown".
设计的芯片的物种。如果用户不知道它，它可以设置为“未知”。


参数：idType
the Illumina ID type
Illumina的ID类型


参数：chipVersion
chipVersion information returned by function getChipInfo  
函数getChipInfo chipVersion返回的信息


参数：...
other parameters of getChipInfo  
其他参数getChipInfo


Details

详情----------Details----------

The parameter "idType" represents different types of Illumina IDs. It returns the entire table when idType = "All". When idType = 'Probe', it returns "ProbeId" or "Probe\_Id". When idType = 'Gene', it returns "Target" or "ILMN\_Gene" IDs.
参数“idType”代表不同类型的Illumina的标识。它返回整个表时idType =“全部”。当idType =探针，它返回“ProbeId的”或“探针\ _id”。当idType =基因，它返回“目标”或“ILMN \ _Gene”标识。

This function basically returned the "idMapping" item returned by function getChipInfo. If nuID is NULL and chipVersion is provided, it will return all mapping information of the chip.
此功能基本上返回“idMapping的”的项目由函数getChipInfo返回。如果nuID是NULL，提供chipVersion，它会返回所有的映射信息的芯片。


值----------Value----------

The mapping information from nuID to Illumina ID. It will be a matrix with each column corresponding to one matched manifest file when parameter "returnAllMatches" is TRUE. In this case, the columns are sorted from the best match to worst.
映射信息从nuID Illumina的编号。这将是一个矩阵每列对应一个匹配的manifest文件时参数“returnAllMatches”为TRUE。在这种情况下，列排序从最佳匹配到最差。


作者（S）----------Author(s)----------


Pan Du



参见----------See Also----------

getChipInfo, IlluminaID2nuID
getChipInfo，IlluminaID2nuID


举例----------Examples----------


        ## load example data[＃加载数据为例]
        data(example.lumi)
        nuIDs <- featureNames(example.lumi)
        if (require(lumiHumanIDMapping)) {
                illuminaID <- nuID2IlluminaID(nuIDs[1:5], lib='lumiHumanIDMapping')
                illuminaID
        }

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