R语言 lumi包 lumiMethyN()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

lumiMethyN(lumi)
lumiMethyN()所属R语言包：lumi

                                         Normalize the Illumina Infinium methylation data
                                         标准化Illumina的Infinium甲基化数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Normalize the Illumina Infinium methylation data, which is an object in MethyLumiM class.
标准化Illumina的Infinium甲基化的数据，这是一个MethyLumiM类的对象。


用法----------Usage----------


lumiMethyN(methyLumiM, method = c("ssn", "quantile", "none"), separateColor = FALSE, verbose = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：methyLumiM
a MethyLumiM object includes Illumina Infinium methylation data
1 MethyLumiM对象包括Illumina的Infinium甲基化数据


参数：method
supported normalization methods or user provided function, whose input and output should be a intensity matrix (pool of methylated and unmethylated probe intensities)  
支持的标准化方法或用户提供的功能，其输入和输出应该是一个强矩阵（甲基化和甲基化的探针强度池）


参数：separateColor
determine whether to separately process two color channels
确定是否单独处理两色通道


参数：verbose
a boolean to decide whether to print out some messages  
一个布尔值，决定是否打印出一些消息


参数：...
other parameters used by corresponding method  
通过相应的方法使用的其他参数


值----------Value----------

Return an object (same class as input methyLumiM) with updated "methylated" and "unmethylated" data matrix after background level adjustment.
与更新“甲基化”和“甲基化”的数据矩阵背景水平调整后返回一个对象（输入methyLumiM同一类）。


作者（S）----------Author(s)----------



Pan DU




参见----------See Also----------

See Also normalizeMethylation.ssn and normalizeMethylation.quantile
normalizeMethylation.ssn和normalizeMethylation.quantile


举例----------Examples----------


data(example.lumiMethy)
lumiMethy.norm = lumiN(example.lumiMethy)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。