R语言 lumi包 addAnnotationInfo()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

addAnnotationInfo(lumi)
addAnnotationInfo()所属R语言包：lumi

                                        Add probe color channel and basic annotation information based on the annotation library of Illumina methylation microarray
                                         新增探针颜色通道和基本的注释信息的基础上，Illumina的甲基化芯片的注解库

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Add probe color channel and basic annotation information based on the annotation library of Illumina methylation microarray
新增探针颜色通道和基本的注释信息的基础上，Illumina的甲基化芯片的注解库


用法----------Usage----------


addAnnotationInfo(methyLumiM, lib = NULL, hgVersion=c('hg19', 'hg18'), annotationColumn=c('COLOR_CHANNEL', 'CHROMOSOME', 'POSITION'))



参数----------Arguments----------

参数：methyLumiM
a MethyLumiM object includes Illumina Infinium methylation data
1 MethyLumiM对象包括Illumina的Infinium甲基化数据


参数：lib
Annotation library of Illumina methylation microarray
Illumina的甲基化芯片的注释库


参数：hgVersion
version of human genome
人类基因组的版本


参数：annotationColumn
only include 'COLOR_CHANNEL', 'CHROMOSOME' and 'POSITION' information
只包括“COLOR_CHANNEL，染色体”和“位置”信息


值----------Value----------

return the MethyLumiM object with COLOR_CHANNEL, CHROMOSOME and chromome POSITION information added to the featureData.
返回的与COLOR_CHANNEL MethyLumiM对象，染色体和添加chromome位置信息的featureData。


作者（S）----------Author(s)----------


Pan DU



参见----------See Also----------

lumiMethyR
lumiMethyR


举例----------Examples----------


        data(example.lumiMethy)
        head(pData(featureData(example.lumiMethy)))
        ## removing color channel information[＃删除颜色通道信息]
        # testData = example.lumiMethy[testData = example.lumiMethy]
        # pData(featureData(testData))$COLOR_CHANNEL = NULL[，PDATA（featureData（testData））$ COLOR_CHANNEL =空]
        # testData = addAnnotationInfo(testData, lib="IlluminaHumanMethylation27k.db")[testData = addAnnotationInfo（LIB =“IlluminaHumanMethylation27k.db testData”）]
        ## check whether the color channel information is added[＃检查是否添加颜色通道信息]
        # head(pData(featureData(testData)))[头（PDATA（featureData（testData）））]
       

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