R语言 limma包 topRomer()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

topRomer(limma)
topRomer()所属R语言包：limma

                                        Top Gene Set Testing Results from Romer
                                         罗默顶部基因组测试结果

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extract a matrix of the top gene set testing results from the romer output.
提取的顶级基因组的测试结果从罗默输出的矩阵。


用法----------Usage----------


topRomer(x,n=10,alternative="up")



参数----------Arguments----------

参数：x
matrix which is the output from romer.
是从罗默输出的矩阵。


参数：n
number of top gene set testing results to be extracted.
基因组测试结果要提取的数目。


参数：alternative
character which can be one of the three possible alternative p values: "up", "down" or "mixed".  
字符可以有三种可能的备选方案P值之一：“向上”，“向下”或“混合”。


Details

详情----------Details----------

This function takes the results from romer and returns a number of top gene set testing results that are sorted by the p values.
此功能从罗默的结果，并返回一个数的基因组测试结果，p值排序。


值----------Value----------

matrix, which is sorted by the "up", "down" or "mixed" p values, with the rows corresponding to estimated p-values for the top number of gene sets and  the columns corresponding to the number of genes for each gene set and the alternative hypotheses mixed, up, down.
矩阵，这是由“向上”，“向下”或“混合”P值与行相应的估计上面的数字和基因组的基因数量为相应的列p值，排序每个基因组和混合替代假说，向上，向下。


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth and Yifang Hu



参见----------See Also----------

romer
romer


举例----------Examples----------


# See romer for examples[见的例子罗默]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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