R语言 limma包 normalizeQuantiles()函数中文帮助文档(中英文对照)

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normalizeQuantiles(limma)
normalizeQuantiles()所属R语言包：limma

                                        Normalize Columns of a Matrix to have the same Quantiles
                                         标准化矩阵的列有相同的位数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Normalize the columns of a matrix to have the same quantiles, allowing for missing values. Users do not normally need to call this function directly - use normalizeBetweenArrays instead.
矩阵具有相同的位数列标准化，从而为遗漏值。用户通常并不需要直接调用此函数 - 使用normalizeBetweenArrays代替。


用法----------Usage----------


normalizeQuantiles(A, ties=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：A
numeric matrix. Missing values are allowed.
数字矩阵。遗漏值是不允许的。


参数：ties
logical. If TRUE, ties in each column of A are treated in careful way. tied values will be normalized to the mean of the corresponding pooled quantiles.
逻辑。如果TRUE，每个A列关系都在谨慎的方式处理。绑的值将被归到相应的汇集位数的平均值。


Details

详情----------Details----------

This function is intended to normalize single channel or A-value microarray intensities between arrays. Each quantile of each column is set to the mean of that quantile across arrays. The intention is to make all the normalized columns have the same empirical distribution. This will be exactly true if there are no missing values and no ties within the columns: the normalized columns are then simply permutations of one another.
此功能是为了规范阵列之间的单通道或A值芯片强度。跨阵列，分量平均每个位数的每一列设置。我们的目的是使所有归列有相同的经验分布。如果有没有缺失值和列内没有关系：归列一个简单的排列，这将是完全正确的。

If there are ties amongst the intensities for a particular array, then with ties=FALSE the ties are broken in an unpredictable order. If ties=TRUE, all the tied values for that array will be normalized to the same value, the average of the quantiles for the tied values.
如果有特定阵列的强度之间的关系，然后用ties=FALSE的关系是一个不可预知的顺序打破。如果ties=TRUE，并列该数组的所有值将被归为相同的值，平均为并列值的位数。


值----------Value----------

A matrix of the same dimensions as A containing the normalized values.
矩阵A包含标准化值相同的尺寸。


作者（S）----------Author(s)----------


Gordon Smyth



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

An overview of LIMMA functions for normalization is given in 05.Normalization.
在05.Normalization标准化LIMMA功能概述。

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