mrlm(limma)
mrlm()所属R语言包：limma
Fit Linear Model to Microrray Data by Robust Regression
适合线性模型，Microrray稳健回归的数据
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Fit a linear model genewise to expression data from a series of arrays. The fit is by robust M-estimation allowing for a small proportion of outliers.
适合线性模型2-6。从一系列阵列基因表达数据。合适的是强劲的M-估计，一个离群的小比例。
用法----------Usage----------
mrlm(M,design=NULL,ndups=1,spacing=1,weights=NULL,...)
参数----------Arguments----------
参数：M
numeric matrix containing log-ratio or log-expression values for a series of microarrays, rows correspond to genes and columns to arrays.
比log或log表达值包含了一系列微阵列的数字矩阵，行对应基因和列数组。
参数：design
numeric design matrix defining the linear model, with rows corresponding to arrays and columns to comparisons to be estimated. The number of rows must match the number of columns of M. Defaults to the unit vector meaning that the arrays are treated as replicates.
数字设计矩阵定义的线性模型，来估计的比较阵列和列相应的行。行数必须匹配M列数。默认的单位向量的含义，阵列被视为重复。
参数：ndups
a positive integer giving the number of times each gene is printed on an array. nrow(M) must be divisible by ndups.
给每一个基因的次数上印有一个正整数数组。 nrow(M)必须ndups整除的。
参数：spacing
the spacing between the rows of M corresponding to duplicate spots, spacing=1 for consecutive spots.
重复点，连续点Mspacing=1相应的行之间的间距。
参数：weights
numeric matrix of the same dimension as M containing weights. If it is of different dimension to M, it will be filled out to the same size. NULL is equivalent to equal weights.
M含权的同一维度的数字矩阵。如果它不同维度M是，将填写的大小相同。 NULL相当于同等重量。
参数：...
any other arguments are passed to rlm.default.
任何其他的参数被传递到rlm.default。
Details
详情----------Details----------
This is a utility function used by the higher level function lmFit. Most users should not use this function directly but should use lmFit instead.
这是一个实用的功能，更高级别的功能lmFit。大多数用户不应该直接使用此功能，但应该使用lmFit代替。
This function fits a linear model for each gene by calling the function rlm from the MASS library.
此功能适合通过调用函数rlm从地下库，为每一个基因的线性模型。
Warning: don't use weights with this function unless you understand how rlm treats weights. The treatment of weights is somewhat different from that of lm.series and gls.series.
警告：不要使用此功能的权重，除非你了解如何rlm对待权。权重的治疗方法是从lm.series和gls.series有所不同。
值----------Value----------
A list with components
与组件列表
参数：coefficients
numeric matrix containing the estimated coefficients for each linear model. Same number of rows as M, same number of columns as design.
数字矩阵的每个线性模型的估计系数。 M，design列相同数量相同的行数。
参数：stdev.unscaled
numeric matrix conformal with coef containing the unscaled standard deviations for the coefficient estimators. The standard errors are given by stdev.unscaled * sigma.
数字矩阵形与coef含有非标度系数估计的标准偏差。标准错误stdev.unscaled * sigma。
参数：sigma
numeric vector containing the residual standard deviation for each gene.
数字矢量含有残留的每一个基因的标准偏差。
参数：df.residual
numeric vector giving the degrees of freedom corresponding to sigma.
数字向量，让sigma相应的自由程度。
参数：qr
QR decomposition of design.
designQR分解。
作者（S）----------Author(s)----------
Gordon Smyth
参见----------See Also----------
rlm.
rlm。
An overview of linear model functions in limma is given by 06.LinearModels.
线性模型功能概述limma由06.LinearModels给出。
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发表于 2012-2-25 23:19:36
