R语言 les包 spikeInStat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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spikeInStat(les)
spikeInStat()所属R语言包：les

                                        Spike-in ChIP-chip data set
                                         穗在芯片的芯片数据集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set is part of a quality control study for tiling microarrays (Johnson et al., 2008), in which spike-ins were used to assess the influence of microarray platforms, preparation procedures, and analysis algorithms on the accuracy and reproducibility of ChIP-chip experiments. Here, the expression intensities of one region from the 'undiluted' data set investigated with Affymetrix arrays is selected, consisting of 452 probes and two conditions with three replicates each. The data has been normalized using quantile normalization and probe positions remapped to a common reference.
该数据集是一个平铺芯片（Johnson等，2008），其中穗插件被用来评估的准确性和重复性芯片的芯片平台，编制程序，并分析算法的影响的质量控制研究的一部分芯片实验。在这里，表达强度的一个区域，从“未稀释的数据集与Affymetrix公司的阵列被选中的调查，452探针和两个条件组成三个重复每个。已标准化的数据位数标准化和重新映射到一个共同的参考探针的位置。


用法----------Usage----------


data(spikeInStat)



格式----------Format----------




pos Vector with probe positions.
POS探针位置的向量。




pval Vector with p-values assessing the differential effect between the conditions with a modified t-test. For details, please
pval的向量p值评估的条件之间的差效应与修改后的t-检验。有关详情，请


源----------Source----------

GEO accession IDs: GSM248996, ..., GSM249001
的土力工程加入ID：GSM248996，...，GSM249001


参考文献----------References----------

Systematic evaluation of variability in ChIP-chip experiments using predefined DNA targets. Genome Research, 18(3):393-403.
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注：
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