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keggDF2graph(keggorthology)
keggDF2graph()所属R语言包：keggorthology

                                        create a graph from a specific data frame format
                                         创建一个从一个特定的数据框格式图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

create a graph from a specific data frame format for KEGG orthology
创建一个从一个特定的数据框格式KEGG直向图


用法----------Usage----------


keggDF2graph(df, root="KO.June07root")
data(KOgraph)



参数----------Arguments----------

参数：df
the data frame
数据框


参数：root
a name for root node
根节点的名称


Details

详情----------Details----------

the obvious directed graph structure from root to leaf nodes (pathway names) is instantiated for the orthology, nodeData attribute tag is loaded with the numerical tag for the term in KEGG, and nodeData attribute depth is loaded with depth from root
明显的有向图结构，从根到叶节点（通路名称）为直向实例被加载，nodeData属性标记为术语在KEGG数值标签，从根深度加载和nodeData属性深入

Based on keggorthology read of KEGG orthology, March 2 2010. Specifically, we run wget on ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg/brite/ko/ko00001.keg and use parsing and modeling code given in inst/keggHTML to generate a data frame respecting the hierarchy, and then keggDF2graph to construct the graph.
基于对keggorthology读KEGG直向，2010年3月2日。具体来说，我们运行的wget的ftp://ftp.genome.jp/pub/kegg/brite/ko/ko00001.keg和使用解析和建模INST / keggHTML的代码生成一个数据框尊重层次上，然后 keggDF2graph构造图。


值----------Value----------

a graphNEL-class instance
graphNEL-class实例


注意----------Note----------

This is only a support function.  The graph is
这仅仅是一个支持功能。图


作者（S）----------Author(s)----------


Vince Carey <stvjc@channing.harvard.edu>



举例----------Examples----------


data(keggOrthDF)
keggOrthDF[1:5,]
data(KOgraph)
nodes(KOgraph)[1:4]
nodeData(KOgraph,,"tag")[1:5]
nodeData(KOgraph,,"depth")[1:5]

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注：
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