R语言 KEGGgraph包 translateKEGGgraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

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translateKEGGgraph(KEGGgraph)
translateKEGGgraph()所属R语言包：KEGGgraph

                                         Tranlate the KEGG graph from being indexed by KEGGID to another
                                         Tranlate KEGG从索引KEGGID的图到另一个

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function translates the KEGG graph into a graph of equivalant topology while index with unique identifiers given by user. The new identifiers could be, for example, GeneSymbol or other identifiers mapped to KEGGID.
而由用户的唯一标识符指数函数转换成一个等效拓扑图KEGG图。新的标识符可能，例如，GeneSymbol或其他标识符映射到KEGGID。


用法----------Usage----------


translateKEGGgraph(graph, newNodes)



参数----------Arguments----------

参数：graph
A KEGG graph  
一个KEGG图


参数：newNodes
A character vector giving the new nodes, must be of the same length and same order of the nodes of the given graph  
一个字符的向量，赋予新的节点，必须是相同的长度和给定的图形节点的顺序相同


Details

详情----------Details----------

The function is still experimental and users are welcomed to report any difficulties
的功能仍然是实验性和用户的欢迎报告任何困难


值----------Value----------

Another graph indexed by the given identifier
给定标识符索引的另一个图


作者（S）----------Author(s)----------


Jitao David Zhang <jitao_david.zhang@roche.com>



举例----------Examples----------


sfile <- system.file("extdata/hsa04010.xml",package="KEGGgraph")
gR <- parseKGML2Graph(sfile,expandGenes=TRUE)

subG <- subKEGGgraph(c("hsa:1848","hsa:1432","hsa:2002","hsa:8986"),gR)
symbols <- c("DUSP6","MAPK14","ELK1","RPS6KA4")
sub2G <- translateKEGGgraph(subG, symbols)
sub2G
nodes(sub2G)

if(require(Rgraphviz) &amp; interactive()) {
plot(sub2G, "neato")
}

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。