parseKGML2Graph(KEGGgraph)
parseKGML2Graph()所属R语言包:KEGGgraph
Parse KGML files into KEGG graph
KEGG图解析成KGML文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function is a wrapper for parseKGML and KEGGpathway2Graph. It takes two actions: first it reads in the KGML file and parses it into an object of KEGGPathway-class, the second step it calls KEGGpathway2Graph function to return the graph model.
此功能是为parseKGML和KEGGpathway2Graph的包装。它有两个措施:第一,它读取在KGML文件,并解析它成KEGGPathway-class的对象,它调用KEGGpathway2Graph函数返回的图模型的第二个步骤。
用法----------Usage----------
parseKGML2Graph(file, ...)
参数----------Arguments----------
参数:file
Name of KGML file
KGML文件的名称
参数:...
other parameters passed to KEGGpathway2Graph, see KEGGpathway2Graph
其他参数传递到KEGGpathway2Graph,看到KEGGpathway2Graph
Details
详情----------Details----------
Note that groups of genes will be split into single genes by calling the KEGGpathway2Graph function. Edges that connected to groups will be duplicated to connect each member of the group.
注意将分裂成单个基因,基因组,通过调用KEGGpathway2Graph功能。连接到组的边缘,将复制到连接各组的成员。
值----------Value----------
A graph object.
一个图形对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Jitao David Zhang <a href="mailto:jitao_david.zhang@roche.com">mailto:jitao_david.zhang@roche.com</a>
举例----------Examples----------
sfile <- system.file("extdata/hsa04010.xml",package="KEGGgraph")
gR <- parseKGML2Graph(sfile,expandGenes=TRUE)
gR
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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