R语言 KEGGgraph包 neighborhood()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

neighborhood(KEGGgraph)
neighborhood()所属R语言包：KEGGgraph

                                         Return the neighborhood set of given vertices
                                         返回给定的顶点附近集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function returns the neighborhood set of given vertices in the form of list. Optionally user can choose to include the given vertices in the list, too.
该函数返回在列表的形式给出的顶点附近集合。可选，用户可以选择，也列入名单中给定的顶点。


用法----------Usage----------


neighborhood(graph, index, return.self = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：graph
An object of graphNEL
一个graphNEL的对象


参数：index
Names of nodes, whose neighborhood set should be returned  
节点，其附近设置的名称应退还


参数：return.self
logical, should the vertex itself also be returned?
逻辑顶点本身，应该也可以退还？


Details

详情----------Details----------

Let v be a vertex in a (di)graph, the out-neighborhood or successor set (N+(v), x belongs to V(G) and v->x) and the in-neighborhood or predecessor set (N-(v), x belongs to V(G) and x->v) are jointly returned.
设v是一个顶点（二）图，一套出居委会或继承人的（N +（V），x属于V（G）和V-X）和居委会或前任集（N （V），X为V（G）和X-V）共同返回。

The returned list is indexed by the given node indices, NULL is returned in case of non-existing node.
返回的列表是由给定的节点索引的索引，NULL节点不存在的情况下返回。

The nodes are unique, that is, duplicated nodes are removed in results.
节点是唯一的，在结果中删除，复制节点。


值----------Value----------

A list indexed by the given node indices, each entry containing the neighborhood set of that node (or furthermore including that node).
由给定的节点指标，每个条目包含的节点（或者还包括节点）设置邻里索引列表。


作者（S）----------Author(s)----------


Jitao David Zhang <jitao_david.zhang@roche.com>



参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


  V <- c("Hamburg","Stuttgart","Berlin","Paris","Bremen")
  E <- list("Hamburg"=c("Berlin","Bremen"),
            "Stuttgart"=c("Berlin","Paris"),
            "Berlin"=c("Stuttgart","Bremen"),
            "Paris"=c("Stuttgart"),
            "Bremen"=c("Hamburg","Berlin"))
  g <- new("graphNEL", nodes=V, edgeL=E, edgemode="directed")
  if(require(Rgraphviz) &amp; interactive()) {
    plot(g, "neato")
  }

  ## simple uses[＃简单的用途]
  neighborhood(g, "Hamburg")
  neighborhood(g, c("Hamburg", "Berlin","Paris"))

  ## in case of non-existing nodes[＃在非现有节点]
  neighborhood(g, c("Stuttgart","Ulm"))

  ## also applicable to non-directed graphs[＃也适用于非定向图]
  neighborhood(ugraph(g), c("Stuttgart","Berlin"))

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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