R语言 KEGGgraph包 KEGGNode-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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KEGGNode-class(KEGGgraph)
KEGGNode-class()所属R语言包：KEGGgraph

                                        Class "KEGGNode"
                                         类“KEGGNode”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The class to present 'entry' element in KGML files and
类到项元素提出在KGML文件


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the function parseEntry and is not intended to be directly created by users.
对象可以通过调用函数创建parseEntry“不打算直接由用户创建的。


插槽----------Slots----------




entryID:  entryID, the 'id' attribute of 'entry' elements in KGML files. In each KGML file the entryID is specified by auto-increment integers, therefore entryIDs from two individual KGML files are not unique. However, if 'expandGenes' option is specified in KEGGpathway2Graph function, the unique KEGGID will replace the default integer as the new entryID, which is
entryID的EntryID，“ID”属性“进入”KGML文件元素。的EntryID在每个KGML文件指定自动递增的整数，因此，从两个独立KGML文件entryIDs是不是唯一的。然而，如果“expandGenes选项在KEGGpathway2Graph函数指定，独特KEGGID将取代作为新的EntryID，这是默认的整数




name: Name of the node
name：节点的名称




type: Type of the node, use data(KEGGNodeType)
type：节点类型，使用data(KEGGNodeType)




link: URL link of the node
link：节点的URL链接




reaction: Reaction of the node
reaction：反应节点




map: Map of the node
map：节点的图




graphics: Graphic details (including display name) of
graphics：图形的细节（包括显示名称）


方法----------Methods----------




getDisplayName signature(object = "KEGGNode"): get
getDisplayNamesignature(object = "KEGGNode")：得到




getEntryID signature(obj = "KEGGNode"): get entryID,
getEntryIDsignature(obj = "KEGGNode")：得到的EntryID




getKEGGID signature(object = "KEGGNode"): get KEGGID
getKEGGIDsignature(object = "KEGGNode")：得到KEGGID的




getType signature(object = "KEGGNode"): get the type of
的getTypesignature(object = "KEGGNode")：类型




<-name signature(object = "KEGGNode"): replace name
<名称signature(object = "KEGGNode")：更换名称




getComponent signature(obj = "KEGGNode"): returns
getComponentsignature(obj = "KEGGNode")：返回




show signature(object = "KEGGNode"): show method
显示signature(object = "KEGGNode")：show方法


作者（S）----------Author(s)----------


Jitao David Zhang <a href="mailto:jitao_david.zhang@roche.com">mailto:jitao_david.zhang@roche.com</a>



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


## We show how to extract information from KEGGNode object[＃我们展示了如何提取KEGGNode对象的信息]
sfile <- system.file("extdata/hsa04010.xml",package="KEGGgraph")
pathway <- parseKGML(sfile)

ns <- nodes(pathway)
node <- ns[[1]]

show(node)
getName(node)
getDisplayName(node)
getEntryID(node)
getKEGGID(node)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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