R语言 KCsmart包 plotScaleSpace()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotScaleSpace(KCsmart)
plotScaleSpace()所属R语言包：KCsmart

                                         Plot multiple significant regions in one figure
                                         图多一个数字的重要区域

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots significant regions in different scale spaces in one figure
在一个数字的不同尺度的空间显著区域的图


用法----------Usage----------


plotScaleSpace(spms, sigLevels, chromosomes=NULL, type='b')



参数----------Arguments----------

参数：spms
List of sample point matrices  
采样点矩阵列表


参数：sigLevels
List of significance levels  
名单显着水平


参数：chromosomes
Takes a vector of chromosomes to be plotted. Defaults to all chromosomes.  
要绘制的染色体向量。所有染色体的默认。


参数：type
Determines which data is plotted. 'g' for gains only, 'l' for losses only and 'b' for both. When type='b' is used, two devices (x11) will be opened.
确定哪些数据绘制。 G的收益，损失只和B为L。当类型=B用于两个设备（X11）将被打开。


Details

详情----------Details----------

Takes sample point matrices that were calculated using (different) kernel widths (sigma), then calculates the significant regions given the cutoffs as defined by 'sigLevels' and plots these in one figure.
注意到采样点矩阵，分别计算使用不同内核的宽度（西格马），然后计算的截止时间为“sigLevels”和一个数字图这些定义的重大区域。


值----------Value----------

Depending on the 'type' parameter, produces one or two plots, one for the gains and one for the losses. The heatmap color indicates the level of the gain or loss.
在“类型”参数的不同，产生一个或两个图，收益和损失。热图的颜色表示的收益或损失的水平。


作者（S）----------Author(s)----------


Jorma de Ronde



参见----------See Also----------

plot
plot


举例----------Examples----------


data(hsSampleData)
data(hsMirrorLocs)

spm1mb <- calcSpm(hsSampleData, hsMirrorLocs)
spm4mb <- calcSpm(hsSampleData, hsMirrorLocs, sigma=4000000)

siglevel1mb <- findSigLevelTrad(hsSampleData, spm1mb, n=3)
siglevel4mb <- findSigLevelTrad(hsSampleData, spm4mb, n=3)

plotScaleSpace(list(spm1mb, spm4mb), list(siglevel1mb, siglevel4mb), type='g')

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。