fromSnpToQuartet(ITALICS)
fromSnpToQuartet()所属R语言包:ITALICS
Function to get from snp to quartet
函数来获取从SNP到四方
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function put the smoothing value of each SNP in front of its corresponding quartet in the quartetInfo data.frame.
此功能把其在相应的quartetInfo数据框四方面前每个SNP的平滑值。
用法----------Usage----------
fromSnpToQuartet(quartetInfo, profilSNP)
参数----------Arguments----------
参数:quartetInfo
a data frame containing all the quartet values plus there GC content, fragment length and GC content and Quartet effect
一个数据框包含所有四方值加上有GC含量片段长度和GC含量和四方的影响
参数:profilSNP
a data frame, corresponding to the profileValues argument of a profilCGH object (see GLAD)
一个数据框,对应的profileValues参数一个profilCGH对象(见GLAD)
值----------Value----------
return the data.frame quartetInfo with an additionnal column: "Smoothing" corresponding to the estimated smoothing value.
返回与additionnal列的数据框quartetInfo:“平滑”对应的估计平滑值。
注意----------Note----------
People interested in tools dealing with array CGH analysis and DNA copy number analysis can
阵列比较基因组杂交分析和DNA拷贝数的分析与处理工具有兴趣的人可以
作者(S)----------Author(s)----------
Guillem Rigaill, <a href="mailto:italics@curie.fr">italics@curie.fr</a>.
源----------Source----------
Institut Curie, italics@curie.fr.
居里研究所,italics@curie.fr。
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注:
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