R语言 isobar包 proteinInfo-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

proteinInfo-methods(isobar)
proteinInfo-methods()所属R语言包：isobar

                                        Methods for Function proteinInfo
                                         方法功能proteinInfo的

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

proteinInfo slot in Proteingroup objects contains information about proteins.  proteinInfo method allows to get and set it,  getProteinInfoFromBiomart downloads information of contained proteins from Biomart.
在Proteingroup对象proteinInfo槽包含关于蛋白质的信息。 proteinInfo方法可以获取和设置，getProteinInfoFromBiomart下载所含的蛋白质信息Biomart。


用法----------Usage----------



  ## S4 method for signature 'ProteinGroup'
proteinInfo(x)

  ## S4 method for signature 'ProteinGroup,character'
proteinInfo(x, protein.g, select="name", collapse=", ")

  getProteinInfoFromBiomart(x, database = "Uniprot")



参数----------Arguments----------

参数：x
ProteinGroup object
ProteinGroup对象


参数：protein.g
Protein group identifier. If supplied, only information for  these proteins is returned.
蛋白质组标识符。如果提供，则返回这些蛋白质的唯一信息。


参数：select
indicating columns to select. See Details.
显示选择的列。查看详细信息。


参数：collapse
passed to paste to concatenate information of multiple protein in one protein group
传递paste串连多个蛋白质的信息，在一个蛋白质组的


参数：database
database from which the ACs stem from.
从ACS的数据库源于。


Details

详情----------Details----------

proteinInfo contains columns accession, name,  gene_name, and protein_name. accession is mapped with the entry AC is mapped to the entry AC in the database.
proteinInfo包含列accession，name，gene_name，protein_name。 accession映射条目AC映射到数据库中的条目AC的。


参见----------See Also----------

protein.g
protein.g


举例----------Examples----------


data(ibspiked_set1)
pg <- proteinGroup(ibspiked_set1)

## Not run: [＃无法运行：]
  proteinInfo(pg) <- getProteinInfoFromBiomart(pg)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

proteinInfo(pg,protein.g="P13635")
protein.g(pg,"CERU")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。