searchMS2(iontree)
searchMS2()所属R语言包:iontree
Search MS2 spectrum from sqlite database
从SQLite数据库的搜索MS2的频谱
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
search MS2 spetra from the database. Ranking is based on the distance metric that defined by Cao et al. 2008, cosine and Tanimoto similarity.
从数据库中搜索MS2的spetra。排名是基于距离度量的定义,曹等。 2008年,余弦和谷本相似。
用法----------Usage----------
searchMS2(querySpec, premz, dbname = "mzDB.db", scoreFun = "distMS2", output.record = 5, plot.top = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:querySpec
query spectrum in 2-col matrix
2彩色矩阵在查询频谱
参数:premz
precursor m/z that query spectrum derived from
易制毒化学的m / z来自查询频谱
参数:dbname
database name
数据库的名称
参数:scoreFun
score function, 'distMS2','cos' or 'tanimoto'
评分功能,distMS2“,”COS“或”谷本“
参数:output.record
the number of records shown in console
在控制台显示的记录数
参数:plot.top
plot query spectrum and the top-ranked spectrum
图查询频谱和排名第一的频谱
值----------Value----------
return top records
返回顶部记录
作者(S)----------Author(s)----------
Mingshu Cao
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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