getMSnRaw(iontree)
getMSnRaw()所属R语言包:iontree
Get MSn raw data
获取MSN的原始数据
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
query MSn data by the attribute of 'msLevel' and get MSn raw data into a R list. Users may just use function "saveMSnRaw" to retrieve ion tree from a data file and avoid a direct Java function call.
查询MSN“msLevel”和MSN成一个R名单原始数据的属性数据。用户可以只使用功能“saveMSnRaw”离子树和检索从一个数据文件,避免了直接的Java函数调用。
用法----------Usage----------
getMSnRaw(msdata, msLevel = 2)
参数----------Arguments----------
参数:msdata
msdata is a reference to a Java ArrayList. Obtained by calling getMSData Java function. msdata=.jcall("XCMS", "Ljava/util/ArrayList;","getMSData", filename);
的msdata是一个Java的ArrayList参考。通过调用getMSData的Java功能。的msdata = jcall(“XCMS”,“Ljava / UTIL / ArrayList的”,“getMSData”,文件名);
参数:msLevel
msLevel in integer
msLevel整数
值----------Value----------
参数:premz
ancestral precursor ions
祖先的易制毒化学离子
参数:rt
retention time
保留时间
参数:msn.sp
a list of spectrum (m/z, intensity)
一个频谱列表(M / Z,强度)
注意----------Note----------
MS1 data could be queried by msLevel=1. The return type is still a list but different components (rt, tic, sp).
MS1的数据可以查询由msLevel = 1。返回的类型仍然是一个名单,但不同的组件(RT,抽搐,SP)。
作者(S)----------Author(s)----------
Mingshu Cao
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|