R语言 inveRsion包 setUpGenoDatFile()函数中文帮助文档(中英文对照)

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setUpGenoDatFile(inveRsion)
setUpGenoDatFile()所属R语言包：inveRsion

                                         Loads genotype data onto R
                                         到ŕ基因型数据加载

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Loads onto an R session genotype data from text files or PLINK files.
加载到一个R基因型数据从文本文件或砰砰文件的会议。


用法----------Usage----------


setUpGenoDatFile(file = "GenoDat.txt", saveRes = FALSE, sortMinor = TRUE)
setUpGenoDatSNPmat(Chr, Geno, Annot, saveRes = FALSE, saveGeno = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：file
character. File path with genotype information   
character。基因型信息的文件的路径


参数：saveRes
logical. Wether results should be saved into file  gDat.RData  
logical。阉结果应保存到文件“ gDat.RData


参数：sortMinor
logical. Whether genotypes should be sorted by minor allele frequency.  
logical。基因型是否应该次要等位基因频率进行排序。


参数：Chr
numeric. Chromosome number
numeric。染色体数目


参数：Geno
snpMatrix. Matrix of raw with genotype data
snpMatrix。 raw基因型数据矩阵


参数：Annot
numeric. Annotation information read from an .bim file
numeric。 .bim文件阅读的注释信息


参数：saveGeno
logical. Wether .txt file should be saved with genotype information   
logical。阉.txt文件应保存基因型信息


值----------Value----------

GenoDat object
GenoDat对象


作者（S）----------Author(s)----------



Alejandro Caceres <a href="mailto:acaceres@creal.cat">acaceres@creal.cat</a>



参见----------See Also----------

GenoDat
GenoDat


举例----------Examples----------


gen <- system.file("extdata", "genotypes.txt", package = "inveRsion")
gDat <-setUpGenoDatFile(file=gen,sortMinor=TRUE,saveRes=FALSE)
gDat

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