R语言 inveRsion包 HaploCode-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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HaploCode-class(inveRsion)
HaploCode-class()所属R语言包：inveRsion

                                        Class "HaploCode"
                                         类“HaploCode”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The object stores the haplotype coding for each of the candidate brake-points. It is typically generated by calling the function codeHaplo on a GenoDat object.
对象存储每个候选人的制动点的单体型编码。它通常由调用函数生成codeHaploGenoDat对象。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of  codeHaplo(objectGenoDat, blockSize, minAllele, saveRes = TRUE, file = NULL, ROI)
可以创建对象调用 codeHaplo(objectGenoDat, blockSize, minAllele, saveRes = TRUE, file = NULL, ROI)


插槽----------Slots----------




haploCode: Object of class "matrix" Haplotype coding into decimal integers
类haploCode成十进制整数编码的单体型"matrix"：对象




blockSize: Object of class "numeric" block size of SNP used to identify the haplotype of each candidate brake-point.
blockSize：类"numeric"SNP块大小的对象，用来确定每个候选制动点的单体型。




minAllele: Object of class "numeric" minimum allele above which candidate brake-points are considered
minAllele：对象类"numeric"最低等位基因上述候选人刹车点被认为是


方法----------Methods----------




initialize signature(.Object = "HaploCode"): Internal, users should use codeHaplo
初始化signature(.Object = "HaploCode")：内部，用户应该使用codeHaplo




show signature(object = "HaploCode"): shows HaploCode
显示signature(object = "HaploCode")：显示HaploCode


作者（S）----------Author(s)----------


Alejandro Caceres <a href="mailto:acaceres@creal.cat">acaceres@creal.cat</a>



参见----------See Also----------

codeHaplo,     GenoDat
codeHaplo，GenoDat


举例----------Examples----------


data(gDat)
hapCode <-codeHaplo(gDat,blockSize=3,minAllele=0.3,saveRes=FALSE)
hapCode

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注：
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