R语言 inveRsion包 getROIs-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getROIs-methods(inveRsion)
getROIs-methods()所属R语言包：inveRsion

                                        Extracts regions of possible inversion events from "scan"
                                         从“扫描”可能反转事件提取物的区域

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

lists the regions of interest in a matrix, given by the overlapping of significant trial segments (of fixed window seize) that may be part of an inversion event.
列出矩阵中的利益的区域，给予重大试验段（抓住固定窗口），这可能是一个反转事件的一部分重叠。


用法----------Usage----------


getROIs(object, thBic)



参数----------Arguments----------

参数：object
scan. Cromosome scanned for inversions with trial segments of fixed window size.  
scan。 cromosome扫描与固定窗口大小的试验段为倒。


参数：thBic
BIC threshold above which overlapping segments are considered for the definition of each ROI   
BIC的阈值以上的重叠部分被认为是每个投资回报率的定义


Details

详情----------Details----------

ROIs are defined as overlapping trial segments with BIC greater than thBIC. The output is a matrix for which each row is one ROI. The first two columns give intervals defining the left brake-points and the two subsequent columns are the intervals for the right brake-points.    ROIs are given in mega-basis.
投资回报被定义为与BIC比thBIC重叠的试验段。输出的是一个矩阵的每一行是一个投资回报率。前两列给定义左刹车点的时间间隔，随后的两列是正确的制动点的时间间隔。投资回报是在大型基础。


值----------Value----------

matrix
matrix


方法----------Methods----------




signature(object = "scan")  list of regions of interest
signature(object = "scan")感兴趣的区域名单


作者（S）----------Author(s)----------



Alejandro Caceres <a href="mailto:acaceres@creal.cat">acaceres@creal.cat</a>



参见----------See Also----------

scan
scan


举例----------Examples----------


data(scanRes)
ROI <- getROIs(scanRes, thBic = 0)
ROI

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注：
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