GenoDatROI-class(inveRsion)
GenoDatROI-class()所属R语言包:inveRsion
Class "GenoDatROI"
类“GenoDatROI”
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
GenoDat defined within an region of interest
GenoDat定义在一个区域的利益
用法----------Usage----------
ROIGenoDat(objectGenoDat, ROI)
参数----------Arguments----------
参数:objectGenoDat
GenoDat
GenoDat
参数:ROI
numeric. Region of interest. 2-component vector that defines the limits of a chromosome segments where an inversions is thought to occur.
numeric。感兴趣区域。 2组分的向量,它定义一个倒被认为是发生染色体片段的限制。
Details
详情----------Details----------
ROIGenoDat is the constructor of the class.
ROIGenoDat类的构造。
类的对象----------Objects from the Class----------
object are created with calls to ROIGenoDat(objectGenoDat, ROI)
对象创建ROIGenoDat(objectGenoDat, ROI)检测
插槽----------Slots----------
genoDat: "matrix" . Genotypes
genoDat:"matrix"。基因型
lociPos: "numeric". Genomic coordinates
lociPos:"numeric"。基因组坐标
alleleSum: "matrix". Total number of variant alleles in the population per SNP
alleleSum:"matrix"。人口每SNP变异等位基因的总数
noMissCount: "matrix". Total number of subjects with no-missing values
noMissCount:"matrix"。没有缺失值的科目总数
ROI: "numeric". Region of interest.
ROI:"numeric"。感兴趣区域。
延伸----------Extends----------
Class "GenoDat", directly.
类"GenoDat",直接。
方法----------Methods----------
initialize signature(.Object = "GenoDatROI")
初始化signature(.Object = "GenoDatROI")
show signature(object = "GenoDatROI")
显示signature(object = "GenoDatROI")
作者(S)----------Author(s)----------
Alejandro Caceres <a href="mailto:acaceres@creal.cat">acaceres@creal.cat</a>
参见----------See Also----------
GenoDat
GenoDat
举例----------Examples----------
data(gDat)
gDatROI<-ROIGenoDat(gDat,ROI=c(1268,1847))
gDatROI
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