getWellFeatures(imageHTS)
getWellFeatures()所属R语言包:imageHTS
Get well metadata, features and annotation information
获取以及元数据,功能和注释信息
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Get well metadata, features and annotation information.
获取以及元数据,功能和注释信息。
用法----------Usage----------
getWellFeatures(x, uname, feature=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:x
An imageHTS object.
一个imageHTS对象。
参数:uname
a character vector, containing well names. See getUnames for details.
字符向量,以及名称。看到getUnames详情。
参数:feature
A character vectors containing the requested features. Default is TRUE, returning all well features.
一个特征向量包含所要求的功能。默认是的TRUE,返回以及功能。
Details
详情----------Details----------
getWellFeatures return fData, the well features loaded during the configure and annotate steps. Features include: controlStatus, the well content status derived from \'plateconf.txt\'.
getWellFeatures回fData,configure和annotate步骤期间加载的良好功能。功能包括:controlStatus,以及内容的地位,从\派生plateconf.txt \。
值----------Value----------
Returns a data frame containing well features.
返回一个数据框包含良好的功能。
作者(S)----------Author(s)----------
Gregoire Pau, <a href="mailto:gregoire.pau@embl.de">gregoire.pau@embl.de</a>, 2010
参见----------See Also----------
fData, configure, annotate
fData,configure,annotate
举例----------Examples----------
## initialize imageHTS object using the local submorph screen[#初始化imageHTS对象使用当地submorph屏幕。]
local = tempdir()
server = system.file('submorph', package='imageHTS')
x = parseImageConf('conf/imageconf.txt', localPath=local, serverURL=server)
x = configure(x, 'conf/description.txt', 'conf/plateconf.txt', 'conf/screenlog.txt')
x = annotate(x, 'conf/annotation.txt')
## select non-empty wells[#选择非空井。]
unames = setdiff(getUnames(x), getUnames(x, content='empty'))
getWellFeatures(x, unames)
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