R语言 IdMappingRetrieval包 AnnotationAffx()函数中文帮助文档(中英文对照)

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AnnotationAffx(IdMappingRetrieval)
AnnotationAffx()所属R语言包：IdMappingRetrieval

                                        The AnnotationAffx class
                                         AnnotationAffx类

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Package:   <br> Class AnnotationAffx<br>
包装方式：参考的类AnnotationAffx参考

Object<br> ~~|<br> ~~+--Annotation<br> ~~~~~~~|<br> ~~~~~~~+--AnnotationAffx<br>
Object参考~~|参考~~+--  Annotation参考~~~~~~~|参考~~~~~~~+--  AnnotationAffx参考

Directly known subclasses:<br> AnnotationNetAffx<br>
直接已知子类：AnnotationNetAffx参考参考

public static class AnnotationAffx<br> extends Annotation<br>
公共静态的类AnnotationAffx参考延伸注释参考

The AnnotationAffx class encapsulates the functionality allowing to retrieve data from the Affymetrix annotation data online repository through the getIdMap() and getDataFrame() calls.
AnnotationAffx类封装的功能，允许通过getIdMap（）和getDataFrame（）调用，从Affymetrix的注释数据的网上资料库检索数据。


用法----------Usage----------


AnnotationAffx(cacheFolderName="Affymetrix", primaryColumn="Probe.Set.ID", secondaryColumn="SwissProt", swap=TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：cacheFolderName
The path to a service cashing directory for a given AnnotationAffx object. The path is relative to the caching subsystem root directory. Default is 'Affymetrix'
服务兑现为某一AnnotationAffx对象目录的路径。缓存子系统的根目录是相对路径。默认是“Affymetrix公司”


参数：primaryColumn
Primary column to be retrieved from a data frame obtained from the Affymetrix annotation repository when getIdMap() is called. Default is 'Probe.Set.ID'.
主列被检索从Affymetrix的注释库，当getIdMap（）被称为“所得的数据框。默认为“Probe.Set.ID”。


参数：secondaryColumn
Secondary column to be retrieved from a data frame obtained from the Affymetrix annotation repository when getIdMap() is called. Default is 'SwissProt'.
辅助列进行检索从Affymetrix的注释库，当getIdMap（）被称为“所得的数据框。默认为“SwissProt数据库”。


参数：swap
Logical indicating if primary and secondary column(s) need to be swapped at the end of the IdMap retrieval during the getIdMap() call.Default is TRUE.
逻辑表示如果需要交换的idMap检索在getIdMap（小学和中学列（S））call.DefaultTRUE。


参数：...
Additional parameters, see Annotation.
额外的参数，请参阅Annotation。


字段和方法----------Fields and Methods----------

Methods:<br>
方法：<BR>

getProbesetList
getProbesetList

setCredentials
setCredentials

Methods inherited from Annotation:<br> getArrayType, getArrayTypes, getColumns, getCredentials, getDataFrame, getFolderName, getIdMap, getRoot, getServiceRoot, init, readDF, setCredentials, setOptions
方法继承注释：的参考getArrayType，getArrayTypes，调用getColumns，getCredentials，getDataFrame，getFolderName，getIdMap，getRoot，getServiceRoot，初始化，readDF，setCredentials，setOptions

Methods inherited from Object:<br> $, $<-, [[, [[<-, as.character, attach, attachLocally, clearCache, clone, detach, equals, extend, finalize, gc, getEnvironment, getFields, getInstantiationTime, getStaticInstance, hasField, hashCode, ll, load, objectSize, print, registerFinalizer, save
从Object继承的方法：参考$，$ < -  [[[[< -  as.character，附加，attachLocally，clearCache，克隆，分离，等于，扩展，定型，GC，getEnvironment，getFields， getInstantiationTime，getStaticInstance，hasField的hashCode，LL，负载，objectSize，打印，registerFinalizer，功能save


作者（S）----------Author(s)----------


Alex Lisovich, Roger Day

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注：
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