ibhClusterEval(ibh)
ibhClusterEval()所属R语言包:ibh
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function calculated interaction based homogeneity for a clustering result.
此函数计算基于交互的同质化的聚类结果。
用法----------Usage----------
ibhClusterEval(cluster, allGenesList, interactionList)
参数----------Arguments----------
参数:cluster
result of clustering
导致聚类
参数:allGenesList
list of genes in the same order of clustering object
在相同的顺序聚类对象的基因列表
参数:interactionList
list containing the interactions. For each gene/protein, the is an entry in the list with "name" containing name of the gen/protein and "interactors" containing the list of genes/proteins interacting with it.
列表,其中包含的相互作用。对于每个基因/蛋白,是“名称”含根/蛋白质和“团团员”包含与它相互作用的基因/蛋白质列表名称列表中的条目。
值----------Value----------
A vector of floats representing interaction based homogeneity for each cluste
的代表为每个cluste互动基于同质化的花车向量
举例----------Examples----------
require(yeastCC)
require(stats)
data(yeastCC)
require(simpIntLists)
data(YeastBioGRIDInteractionUniqueId)
subset <- exprs(yeastCC)[1:50,]
d <- dist(subset,method="euclidean")
k <- kmeans(d, 3);
ibhClusterEval(k$cluster, rownames(subset),
YeastBioGRIDInteractionUniqueId)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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