plotCtPairs(HTqPCR)
plotCtPairs()所属R语言包：HTqPCR
Pairwise scatterplot of multiple sets of Ct values from qPCR data.
两多套qPCR数据的Ct值的散点图。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Produces a plot of high-throughput qPCR Ct values from N number of samples plotted pairwise against each other in an N by N plot. The Ct values will be in the upper triangle, and the correlation between samples in the lower. Features can be marked based on for example feature class or type.
绘制在N由N图互相成对产生高通量的定量PCR的Ct值从N样本数的积。 Ct值将在上三角，在较低的样本之间的相关性。例如要素类或类型的基础上，可以标记功能。
用法----------Usage----------
plotCtPairs(q, cards = TRUE, lower.panel = panel.Ct.cor, upper.panel = panel.Ct.scatter, Ct.max = 35, col = "type", pch = 20, cex.cor = 2, cex.pch = 1, diag = TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数：q
object of class qPCRset.
对象类qPCRset。
参数：cards
vector, the cards to plot against each other.
向量，卡暗算对方。
参数：lower.panel
function, to use for plotting the lower triangle.
功能，使用较低的三角形绘制。
参数：upper.panel
function, to use for plotting the upper triangle.
功能，使用上的三角形绘制。
参数：Ct.max
numeric, Ct values above this limit will be excluded when calculating the correlation.
数字，CT值高于此限额将被排除在外时，计算的相关性。
参数：col
vector with the colour(s) to use for the points, or a character string ("type" or "class") indicating whether points should be coloured according to featureType or featureClass of q.
向量与颜色（点）使用，或一个字符串（“类型”或“类”），表示是否点应该是彩色的，根据featureType或featureClassq。
参数：pch
integer or single character, which plotting symbol to use for the points.
整数或单个字符，绘图符号使用的点。
参数：cex.cor
numeric, the expansion factor for the text in panel.Ct.cor.
数字，膨胀系数为panel.Ct.cor文本。
参数：cex.pch
numeric, the expansion factor for the points in panel.Ct.scatter.
数字，在panel.Ct.scatter点的膨胀系数。
参数：diag
logical, should the diagonal line y=x be plotted.
逻辑，应对角线Y = X是绘制。
参数：...
any other arguments are passed to the panel functon or pairs.
任何其他参数被传递到面板functon或pairs的。
Details
详情----------Details----------
Per default, the lower panels contain the correlations between data sets. For each correlation all complete pairs are used, i.e. NAs are ignored. If there are no complete observations between two samples the correlation will be set to NA.
每默认情况下，较低的面板包含的数据集之间的相关性。对于每一个完整的对使用相关，即NAS被忽略。如果有两个样本之间没有完整的意见的相关性将被设置为NA。
值----------Value----------
A figure is generated in the current graphics device.
在当前图形设备生成一个数字。
作者（S）----------Author(s)----------
Heidi Dvinge
参见----------See Also----------
pairs or plotCtScatter for plotting just two samples.
pairs或plotCtScatter图只有两个样本。
举例----------Examples----------
# Load example data[加载示例数据]
data(qPCRraw)
# Various types of plot[各种类型的图]
plotCtPairs(qPCRraw, cards=1:4)
plotCtPairs(qPCRraw, col="black")
plotCtPairs(qPCRraw, Ct.max=40)
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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 21:50:37
