R语言 HTqPCR包 plotCtBoxes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotCtBoxes(HTqPCR)
plotCtBoxes()所属R语言包：HTqPCR

                                        Boxplots for qPCR Ct values.
                                         定量PCR的Ct值的盒状图。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function for making boxplots of Ct values from high-throughput qPCR data. The boxes can be made either using all values on each card, or stratified by different feature information.
功能的高通量qPCR数据的Ct值的盒状图。可以使用每张卡上的所有值，或按不同功能的信息分层的框。


用法----------Usage----------


plotCtBoxes(q, cards = TRUE, xlab = "", col, main = NULL, names, stratify = "type", mar = c(7, 4, 3, 1), ...)



参数----------Arguments----------

参数：q
object of class qPCRset.  
对象类qPCRset。


参数：cards
vector, the numbers of the cards to plot. Defaults to TRUE = all cards.
向量，卡的数量来绘制。默认为TRUE =所有卡片。


参数：xlab
character string, label for the x-axis.
字符串，x轴的标签。


参数：col
vector of colours to use, defaults to different colour for each card.
向量使用的颜色，默认为每张卡不同的颜色。


参数：main
character string, plot title.
字符串，小区称号。


参数：names
vector, names to plot under the boxes. Defaults to sample names.
向量，名称下绘制的框。样品名称默认值。


参数：stratify
character, specifying what to stratify the Ct values by. NULL, the default means no stratification, "type" is the feature types of the qPCRset, and "class" the feature class.
字符，指定什么分层Ct值。 NULL，则默认情况下是指无分层，“型”特征类型的qPCRset，“下课”的要素类。


参数：mar
vector, the size of the margins. See par for details.
向量，利润的大小。看到par详情。


参数：...
any other arguments will be passed to the boxplot or parfunction.
任何其他参数将被传递给boxplot或par函数。


Details

详情----------Details----------

For the stratified plots all boxes with Ct values from the same card are plotted in identical colours. "type" and "class" are automatically extracted from the qPCRset using featureType and featureClass.
从相同的卡Ct值的分层图框绘制在相同颜色的。 “类型”和“类”自动提取使用featureType和featureClassqPCRset。


值----------Value----------

A plot is created on the current graphics device.
当前图形设备上创建一个图。


作者（S）----------Author(s)----------


Heidi Dvinge



参见----------See Also----------

boxplot
boxplot


举例----------Examples----------


# Loading the data[加载数据]
data(qPCRraw)
# Make plot with all samples or just a few[所有样品图或少数几个]
plotCtBoxes(qPCRraw, stratify=NULL)
plotCtBoxes(qPCRraw, cards=c(1,4))
plotCtBoxes(qPCRraw, stratify="class")

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