calcTm(HELP)
calcTm()所属R语言包：HELP
Calculate Tm
计算的Tm
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Calculate melting temperature (Tm) using the nearest-neighbor base-stacking algorithm and the unified thermodynamic parameters.
计算温度（Tm）使用的近邻碱基的叠加算法和统一的热力学参数。
用法----------Usage----------
calcTm(x, ...)
参数----------Arguments----------
参数：x
characters containing nucleotide sequences (ex: "ATCGGAA") or an object of class ExpressionSet
含有的核苷酸序列（例如："ATCGGAA"）或对象类ExpressionSet的字符
参数：...
Additional arguments passed to methods:
额外的参数传递给方法：
strand1.concentration numeric value specifying concentration of strand 1 (default is 2e-07)
strand1.concentration数值指定链浓度1（默认是2E-07）
strand2.concentration numeric value specifying concentration of strand 2 (default is 2e-07)
strand2.concentration数值指定链2浓度（默认是2E-07）
method character value specifying the Tm algorithm to use (default is "nearest-neighbor"); currently not supported
method指定TM算法使用的字符值（默认是"nearest-neighbor"）目前不支持
值----------Value----------
Returns a numerical value indicating the predicted melting temperature (Tm) of the sequence in degrees Celsius. A value of NA is returned if the function encounters an error that prevents proper Tm calculation.
返回一个数值，表示摄氏度序列预测熔融温度（TM）。返回功能，如果遇到合适的TM计算错误，防止一个值NA。
作者（S）----------Author(s)----------
Reid F. Thompson (<a href="mailto:rthompso@aecom.yu.edu">rthompso@aecom.yu.edu</a>)
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
#demo(pipeline,package="HELP")[演示（管道，包=“帮助”）]
calcTm("GTGTGGCTACAGGTGGGCCGTGGCGCACCTAAGTGAGGACAGAGAACAAC")
calcTm("GTGTGGCTACAGGTGGGCCGTGGCGCACCTAAGTGAGGACAGAGAACAAC",strand1.concentration=1E-5,strand2.concentration=2E-8)
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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 21:34:01
