R语言 HELP包 calcPrototype()函数中文帮助文档(中英文对照)

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calcPrototype(HELP)
calcPrototype()所属R语言包：HELP

                                         Calculate prototype
                                         计算原型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculates prototype (trimmed mean) across all samples
原型（修剪平均计算所有样品）


用法----------Usage----------


calcPrototype(x, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
a numeric matrix, where each column represents a different sample  
数字矩阵，每一列代表一个不同的样本


参数：...
Arguments to be passed to methods (see calcPrototype-methods):     
被传递到方法的参数（见calcPrototype-methods）：

element which element of AssayData to use for a given ExpressionSet input (default is "exprs")  
element元素AssayData使用一个给定的ExpressionSet输入（默认为"exprs"）

samples which samples to use as data. Can be a vector of characters matching sample names, integers indicating which samples to choose, or a mixture of the two. If NULL (default), all samples will be used.  
samples样品使用的数据。可以是一个矢量字符匹配样本的名称，表示样本选择的整数，或两者的混合物。如果NULL（默认），所有样品将使用。

center logical; if TRUE (default) samples will be mean-centered before protototype calculation. If FALSE, this mean-centering step will be skipped   
center逻辑，如果TRUE（默认）样品前protototype计算意味着为本。如果FALSE，这意味着定心一步将被跳过

trim the fraction (0 to 0.5, default is 0.1) of observations to be trimmed from each end of each row and column in x before the mean is computed.   
trim意见分数（0至0.5，默认为0.1），从每一行和每一列中的每一端修剪x前平均计算。

verbose logical; if TRUE (default) progress will be output to screen. If FALSE, no output will be displayed.  
verbose逻辑;如果TRUE（默认）的进展将是向屏幕输出。如果FALSE，没有输出将显示。

\dots other arguments to be passed to mean. See mean.     
\dots可以通过mean其他参数。看到mean。


值----------Value----------

Returns a vector of numerical data, representing the prototype ([trimmed] mean) of all samples in x.
返回的数值数据的向量，占所有样品的原型在x（[修剪]平均）。


作者（S）----------Author(s)----------


Mark Reimers (<a href="mailto:mreimers@vcu.edu">mreimers@vcu.edu</a>), Reid F. Thompson (<a href="mailto:rthompso@aecom.yu.edu">rthompso@aecom.yu.edu</a>)



参见----------See Also----------

calcPrototype-methods, mean
calcPrototype-methods，mean


举例----------Examples----------


#demo(pipeline,package="HELP")[演示（管道，包=“帮助”）]

x <- matrix(data=rep(1:1000,10),nrow=1000,ncol=10)
x <- x*(sample(1:100/100,size=10000,replace=TRUE))
x <- t(t(x)-1000*(1:10))
x[c(1:10,991:1000),]
x.avg <- calcPrototype(x)
x.avg[c(1:10,991:1000)]

#rm(x,x.avg)[RM（X，x.avg）]

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