R语言 HELP包 calcGC()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

calcGC(HELP)
calcGC()所属R语言包：HELP

                                         Calculate GC percent
                                         计算的GC％

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to calculate GC percent from a nucleotide sequence input
从核苷酸序列输入函数来计算的GC％


用法----------Usage----------


calcGC(x, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
characters containing nucleotide sequence (ex: "ATCGGAA") or an object of class ExpressionSet  
字符含有的核苷酸序列（例如："ATCGGAA"）或一个类的对象ExpressionSet


参数：...
Other arguments passed to methods:     
其他参数传递给方法：

allow vector of characters specifying what other characters to allow in sequence (default is "N")      
allow向量指定其他字符允许在序列的字符（默认是"N"）


值----------Value----------

Returns a numerical value (from 0 to 1) indicating the C+G content of the sequence, corresponding to the fraction of (C+G)/(A+T+C+G...). A value of NA is returned if the function encounters an error that prevents proper calculation of GC percent.
返回一个数值（从01）说明了C + G含量的顺序，相应的分数（+）/（+的T +的C + G。.. ）。如果该函数返回遇到一个错误，防止适当的GC％计算值的NA。


作者（S）----------Author(s)----------


Reid F. Thompson (<a href="mailto:rthompso@aecom.yu.edu">rthompso@aecom.yu.edu</a>)



参见----------See Also----------

calcGC-methods, calcTm
calcGC-methods，calcTm


举例----------Examples----------


#demo(pipeline,package="HELP")[演示（管道，包=“帮助”）]

calcGC("AAAACGCG")
calcGC(sequence="cXgXcXgXcXgX",allow="X")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。