filterGeneSets(GSVA)
filterGeneSets()所属R语言包:GSVA
Filter gene sets
筛选基因组
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Filters gene sets through a given minimum and maximum set size.
通过一个给定的最小和最大的集大小设置过滤器的基因。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'list'
filterGeneSets(gSets, min.sz=1, max.sz=Inf)
## S4 method for signature 'GeneSetCollection'
filterGeneSets(gSets, min.sz=1, max.sz=Inf)
参数----------Arguments----------
参数:gSets
Gene sets given either as a list or a GeneSetCollection object.
基因集作为list或GeneSetCollection对象的。
参数:min.sz
Minimum size.
最小尺寸。
参数:max.sz
Maximum size.
最大大小。
Details
详情----------Details----------
This function filters the input gene sets according to a given minimum and maximum set size.
这个函数过滤输入基因组根据一个给定的最大和最小集的大小。
值----------Value----------
A collection of gene sets that meet the given minimum and maximum set size.
满足给定的最小和最大的集大小的基因组的集合。
作者(S)----------Author(s)----------
J. Guinney
参考文献----------References----------
GSVA: Gene Set Variation Analysis, submitted
参见----------See Also----------
computeGeneSetsOverlap
computeGeneSetsOverlap
举例----------Examples----------
geneSets <- list(set1=as.character(1:4), set2=as.character(4:10))
filterGeneSets(geneSets, min.sz=5)
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