R语言 GSRI包 read-functions()函数中文帮助文档(中英文对照)

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read-functions(GSRI)
read-functions()所属R语言包：GSRI

                                         Import of ‘.cls’ and ‘.gct’ files
                                         导入“。CLS”和“GCT”文件。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Import the groups from ".cls" files and the expression data from ".gct" files.
从.cls文件和表达数据，从.gct文件导入组。


用法----------Usage----------


readCls(file, ...)
readGct(file, ...)



参数----------Arguments----------

参数：file
Character vector specifying the path of the file to be read in.
特征向量指定要读入的文件路径


参数：...
Optinal arguments, currently not used.
optinal参数，目前没有使用。


Details

详情----------Details----------

With these methods the expression data and the assignment of the samples to groups can be read from ".cls" (categorical class) and ".gct" (gene cluster text) files, respectively. Details on the specific formats can be found at http://www.broadinstitute.org/cancer/software/gsea/wiki/index.php/Data_formats.
表达数据和样品分配到组，使用这些方法可以读.cls（分类类）和.gct（基因簇文本）文件，分别为。细节上的具体格式可以发现在http://www.broadinstitute.org/cancer/software/gsea/wiki/index.php/Data_formats。

Please note that the readCls method reads only categorical class labels, not continuous ones.
请注意，readCls方法读取类别类的标签，而不是连续的。


值----------Value----------

For a ".cls" file, a factor containing the groups.
一个.cls文件，包含组的一个因素。

For a ".gct" file, a matrix containing the expression intensities, with rows corresponding to genes and columns to samples.
“.gct文件，含有的表达强度与样品的基因和列对应的行矩阵。


作者（S）----------Author(s)----------



Julian Gehring

Maintainer: Julian Gehring <julian.gehring@fdm.uni-freiburg.de>




参见----------See Also----------

Package: GSRI-package
包装：GSRI-package

Class: Gsri
类别：Gsri

Methods: gsri   getGsri getCdf getParms export sortGsri plot show summary readCls readGct
方法：gsrigetGsrigetCdfgetParmsexportsortGsriplotshowsummary<X >readCls


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
exprs <- readGct(file)

groups <- readCls(file)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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