get-methods(GSRI)
get-methods()所属R语言包：GSRI
Get methods for Gsri class
获取类Gsri方法
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Access and extract results from an object of class Gsri.
访问和提取类Gsri对象的结果。
用法----------Usage----------
getGsri(object, index, ...)
getCdf(object, index, ...)
getParms(object, ...)
参数----------Arguments----------
参数：object
An object of class Gsri whose results to access.
类Gsri的结果来访问对象。
参数：index
Optional argument used to subset the results of individual gene sets. For details, see the plot method.
可选的参数用于个体基因组的结果子集。有关详细信息，请参阅plot方法。
参数：...
Additional arguments, currently not used.
额外的参数，目前没有使用。
Details
详情----------Details----------
getGsri returns a data frame with the results of the GSRI analysis, equivalent to the display of the print and show method. For each gene set it contains the estimated fraction and total number of regulated genes, the standard deviation of the estimated fraction, the GSRI, and the total number of genes in the analysis.
getGsri返回一个数据框与的GSRI分析的结果，相当于print和show方法显示。对于每一个基因的设置，它包含估计的分数和调节基因总数的估计分数GSRI和总数的基因分析的标准偏差。
getCdf returns a data frame with ECDF of the p-values for a gene set.
getCdf返回一个与厄立特里亚社区发展基金的一个基因组的p值的数据框。
getParms returns a list with the parameters used in the analysis, including the weights (weight) for each gene in the gene set, the number (nBoot) of bootstraps for the calculation of the GSRI, the function (test) and its arguments (testArgs) used for assessing the differential effect between the groups, the confidence level for the GSRI, and the application of the Grenander estimatior (grenander) in the calculation of the ECDF.
getParms返回列表在分析中使用的参数，包括重量（weight）每个基因在基因组的计算，白手起家的数量（nBoot） GSRI，函数（test）和它的参数（testArgs）用于评估之间的群体，置信水平为GSRI，和应用Grenander estimatior的效果差（grenander ）在厄立特里亚社区发展基金的计算。
值----------Value----------
getGsri and getCdf return data frame with the results from the GSRI analysis and the ECDF, respectively. getParms returns a list with the parameters used in the analysis.
getGsri和getCdf返回的数据框的GSRI分析和厄立特里亚社区发展基金，分别从结果。 getParms返回在分析中使用的参数列表。
If more than one gene set is accessed, a list with one element per gene set is returned.
如果访问一个以上的基因组，基因组的每一个元素的列表返回。
作者（S）----------Author(s)----------
Julian Gehring
Maintainer: Julian Gehring <julian.gehring@fdm.uni-freiburg.de>
参见----------See Also----------
Package: GSRI-package
包装：GSRI-package
Class: Gsri
类别：Gsri
Methods: gsri getGsri getCdf getParms export sortGsri plot show summary readCls readGct
方法：gsrigetGsrigetCdfgetParmsexportsortGsriplotshowsummary<X >readCls
举例----------Examples----------
## Not run: [＃无法运行：]
getGsri(object)
getCdf(object)
getParms(object)
## End(Not run)[＃结束（不运行）]
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发表于 2012-2-25 21:18:46
