R语言 GSEABase包 incidence-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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incidence-methods(GSEABase)
incidence-methods()所属R语言包：GSEABase

                                        Methods for Constructing Incidence Matricies Between GeneSets
                                         构建GeneSets间发病的基质中的方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

An incidence matrix summarizes shared membership of gene identifiers across (pairs of) gene sets.
关联矩阵总结共享跨越（双）基因组基因标识的成员。


方法----------Methods----------

The return value is a matrix with rows representing gene sets and columns genes.
返回值是一个矩阵的行代表基因组和列基因。

All additional arguments ... are of the same class as x. The incidence matrix contains elements 0 (genes not present) or 1 (genes present).
所有额外的参数...是x同一类。关联矩阵包含元素0（基因不存在）或1（基因存在）。

Additional arguments ... can be of class GeneSetCollection or GeneSet. The incidence matrix contains elements 0 (genes not present) or 1 (genes present).
额外的参数...类GeneSetCollection或GeneSet。关联矩阵包含元素0（基因不存在）或1（基因存在）。


举例----------Examples----------


fl <- system.file("extdata", "Broad.xml", package="GSEABase")
gss &lt;- getBroadSets(fl) # GeneSetCollection of 2 sets[GeneSetCollection的2套]
## From one or more GeneSetCollections...[＃从一个或多个GeneSetCollections ......]
imat <- incidence(gss)
dim(imat)
imat[,c(1:3,ncol(imat)-3+1:3)]

## .. or GeneSets[＃..或GeneSets]
imat1 <- incidence(gss[[1]], gss[[2]], gss[[1]])
imat1[,1:5]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。