GSEABase-package(GSEABase)
GSEABase-package()所属R语言包:GSEABase
Gene set enrichment data structures and methods
基因组富集的数据结构和方法
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This package provides classes and methods to support Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). The GeneSet class provides a common data structure for representing gene sets. The GeneColorSet class allows genes in a set to be associated with phenotypes. The GeneSetCollection class facilitates grouping together a list of related gene sets. The GeneIdentifierType class hierarchy reflects how genes are represented (e.g., Entrez versus symbol) in the gene set. mapIdentifiers provides a way to convert identifiers in a set from one type to another. The CollectionType class hierarchy reflects how the gene set was made, and can order genes into distinct sets or collections.
这个包提供的类和方法,以支持基因组富集分析(GSEA)。 GeneSet类为代表基因组提供了一个共同的数据结构。 GeneColorSet类允许在与表型相关的基因。 GeneSetCollection类便于组合在一起的相关基因组名单。 GeneIdentifierType的类层次反映了基因是如何在基因组的代表(例如,Entrez的与符号)。 mapIdentifiers提供一种方法来转换从一种类型到另一套标识符。 CollectionType类层次反映基因组是如何取得的,可以责令基因分成不同的组或集合。
作者(S)----------Author(s)----------
Written by Martin Morgan, Seth Falcon, Robert Gentleman.
Maintainer: Biocore Team c/o BioC user list <bioconductor@stat.math.ethz.ch>
参见----------See Also----------
GeneSet, GeneColorSet GeneSetCollection
GeneSet,GeneColorSet GeneSetCollection
举例----------Examples----------
example(GeneSet)
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注:
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